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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Inferring patterns of ancestral whole genome duplications (paleopolyploidy) in chelicerates

Descripción del proyecto

Seguimiento de las duplicaciones del genoma completo en la evolución de los invertebrados

La duplicación del genoma completo (DGC) —la duplicación de todo el material genético de un organismo— es una poderosa fuerza evolutiva que fomenta la innovación y la adaptación. Está bien documentada en plantas y algunos vertebrados, pero su función en invertebrados sigue sin estar clara. Con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, el proyecto CheliPloidy investigará la DGC en quelicerados como arañas y escorpiones. Mediante el uso de herramientas genómicas y filogenéticas avanzadas, identificará señales de duplicación antiguas y pondrá a prueba escenarios evolutivos contrapuestos. Los hallazgos aclararán el calendario y la frecuencia de la DGC y pondrán de relieve la evolución genómica y la diversificación de este linaje clave de artrópodos.

Objetivo

Whole genome duplication (WGD) is a drastic event that results in the creation of new genetic material and has been suggested to play a major role in evolutionary innovations and adaptation. While ancestral WGDs (paleoploidizations) are common in plants, only a handful examples have been proposed in animals, such as in vertebrates or salmons. Among invertebrates, WGD events have been inferred in chelicerates, an arthropod clade including marine and terrestrial groups – the arachnids. Specifically, a shared event in the common ancestor of spider and scorpions, and up to 3 independent rounds in the marine horseshoe crabs. However, many of these inferences are mostly based on evidence from few loci, such as Hox genes, with a recent study questioning the validity of these conclusions. Therefore, genome-wide investigations with a diverse taxon sampling may help to answer how many paleoploidization events have taken place in chelicerates.

The CheliPloidy project will investigate the signals of WGD in chelicerates using newly assembled complete genome encompassing most of their diversity. Importantly, no study has considered that return to diploidy may have happened at different intervals (delayed rediploidization), scenario compatible with the different gene histories seen in the group. We will employ multiple state-of-the-art methods and develop novel ones to look for these signals. For example, we will analyse thousands of gene families trees, assess their synteny, and compare signals of divergence among within-species paralogs (including ohnologs derived from the WGD). As the phylogeny of chelicerates is contentious, we will test the most likely scenarios –alternative backbone trees– to polarize patterns of WGD (how many and which are shared). Altogheter, this project will not only sheds light on the complex genome evolution and the phylogeny of chelicerates, but also demonstrates how a combination of comparative methods can be used to infer signals of ancient WGDs.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo.
La clasificación de este proyecto ha sido validada por personas.

Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

UNIVERSITAT DE BARCELONA
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 194 074,56
Dirección
GRAN VIA DE LES CORTS CATALANES 585
08007 BARCELONA
España

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Región
Este Cataluña Barcelona
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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Socios (1)

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