Opis projektu
Śledzenie duplikacji całego genomu w ewolucji bezkręgowców
Duplikacja całego genomu (ang. whole genome duplication, WGD) – podwojenie całego materiału genetycznego organizmu – jest potężną siłą ewolucyjną, która sprzyja nabywaniu nowych cech i adaptacji. Proces ten jest dobrze udokumentowany u roślin i niektórych kręgowców, ale jego rola u bezkręgowców pozostaje niejasna. Zespół projektu CheliPloidy, realizowanego przy wsparciu z działań „Maria Skłodowska-Curie”, będzie badał WGD u organizmów szczękoczułkopodobnych (chelicerates), takich jak pająki i skorpiony. Wykorzystując zaawansowane narzędzia genomiczne i filogenetyczne, badacze zidentyfikują pradawne sygnały duplikacji i przetestują konkurencyjne scenariusze ewolucyjne. Ich ustalenia pomogą określić ramy czasowe i częstotliwość WGD oraz rzucą światło na ewolucję genomową i dywersyfikację tej kluczowej linii stawonogów.
Cel
Whole genome duplication (WGD) is a drastic event that results in the creation of new genetic material and has been suggested to play a major role in evolutionary innovations and adaptation. While ancestral WGDs (paleoploidizations) are common in plants, only a handful examples have been proposed in animals, such as in vertebrates or salmons. Among invertebrates, WGD events have been inferred in chelicerates, an arthropod clade including marine and terrestrial groups – the arachnids. Specifically, a shared event in the common ancestor of spider and scorpions, and up to 3 independent rounds in the marine horseshoe crabs. However, many of these inferences are mostly based on evidence from few loci, such as Hox genes, with a recent study questioning the validity of these conclusions. Therefore, genome-wide investigations with a diverse taxon sampling may help to answer how many paleoploidization events have taken place in chelicerates.
The CheliPloidy project will investigate the signals of WGD in chelicerates using newly assembled complete genome encompassing most of their diversity. Importantly, no study has considered that return to diploidy may have happened at different intervals (delayed rediploidization), scenario compatible with the different gene histories seen in the group. We will employ multiple state-of-the-art methods and develop novel ones to look for these signals. For example, we will analyse thousands of gene families trees, assess their synteny, and compare signals of divergence among within-species paralogs (including ohnologs derived from the WGD). As the phylogeny of chelicerates is contentious, we will test the most likely scenarios –alternative backbone trees– to polarize patterns of WGD (how many and which are shared). Altogheter, this project will not only sheds light on the complex genome evolution and the phylogeny of chelicerates, but also demonstrates how a combination of comparative methods can be used to infer signals of ancient WGDs.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja tego projektu została potwierdzona przez człowieka.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja tego projektu została potwierdzona przez człowieka.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
08007 Barcelona
Hiszpania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.