Description du projet
Retracer les duplications du génome entier dans l’évolution des invertébrés
La duplication du génome entier (WGD pour «whole genome duplication») – le doublement de l’ensemble du matériel génétique d’un organisme – est une puissante force évolutive qui favorise l’innovation et l’adaptation. Elle est bien documentée chez les plantes et certains vertébrés, mais son rôle chez les invertébrés reste incertain. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet CheliPloidy étudiera les troubles de la croissance chez les chélicérates tels que les araignées et les scorpions. À l’aide d’outils génomiques et phylogénétiques avancés, l’équipe identifiera d’anciens signaux de duplication et testera des scénarios évolutifs concurrents. Les résultats clarifieront la chronologie et la fréquence de la maladie de Willebrand et mettront en évidence l’évolution génomique et la diversification de cette lignée clé d’arthropodes.
Objectif
Whole genome duplication (WGD) is a drastic event that results in the creation of new genetic material and has been suggested to play a major role in evolutionary innovations and adaptation. While ancestral WGDs (paleoploidizations) are common in plants, only a handful examples have been proposed in animals, such as in vertebrates or salmons. Among invertebrates, WGD events have been inferred in chelicerates, an arthropod clade including marine and terrestrial groups – the arachnids. Specifically, a shared event in the common ancestor of spider and scorpions, and up to 3 independent rounds in the marine horseshoe crabs. However, many of these inferences are mostly based on evidence from few loci, such as Hox genes, with a recent study questioning the validity of these conclusions. Therefore, genome-wide investigations with a diverse taxon sampling may help to answer how many paleoploidization events have taken place in chelicerates.
The CheliPloidy project will investigate the signals of WGD in chelicerates using newly assembled complete genome encompassing most of their diversity. Importantly, no study has considered that return to diploidy may have happened at different intervals (delayed rediploidization), scenario compatible with the different gene histories seen in the group. We will employ multiple state-of-the-art methods and develop novel ones to look for these signals. For example, we will analyse thousands of gene families trees, assess their synteny, and compare signals of divergence among within-species paralogs (including ohnologs derived from the WGD). As the phylogeny of chelicerates is contentious, we will test the most likely scenarios –alternative backbone trees– to polarize patterns of WGD (how many and which are shared). Altogheter, this project will not only sheds light on the complex genome evolution and the phylogeny of chelicerates, but also demonstrates how a combination of comparative methods can be used to infer signals of ancient WGDs.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
La classification de ce projet a été validée par des humains.
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La classification de ce projet a été validée par des humains.
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
08007 BARCELONA
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.