Projektbeschreibung
Gesamtgenomduplizierung in Evolution der Wirbellosen nachverfolgen
Die Gesamtgenomduplizierung, die Verdopplung des gesamten genetischen Materials eines Organismus, birgt eine starke evolutionäre Kraft, die Innovation und Anpassung begünstigt. Sie ist bei Pflanzen und einigen Wirbeltieren gut dokumentiert, aber ihre Rolle bei Wirbellosen ist noch unklar. Mit Unterstützung der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen wird im Rahmen des Projekts CheliPloidy die Gesamtgenomduplizierung bei Cheliceraten wie Spinnen und Skorpionen untersucht. Mithilfe fortgeschrittener genomischer und phylogenetischer Instrumente werden vorzeitliche Duplikationssignale identifiziert und konkurrierende evolutionäre Szenarien getestet. Die Ergebnisse werden zur Klärung des Zeitpunkts und der Häufigkeit der Gesamtgenomduplizierung beitragen sowie die genomische Evolution und Diversifizierung dieser wichtigen Gliederfüßer-Abstammungslinie beleuchten.
Ziel
Whole genome duplication (WGD) is a drastic event that results in the creation of new genetic material and has been suggested to play a major role in evolutionary innovations and adaptation. While ancestral WGDs (paleoploidizations) are common in plants, only a handful examples have been proposed in animals, such as in vertebrates or salmons. Among invertebrates, WGD events have been inferred in chelicerates, an arthropod clade including marine and terrestrial groups – the arachnids. Specifically, a shared event in the common ancestor of spider and scorpions, and up to 3 independent rounds in the marine horseshoe crabs. However, many of these inferences are mostly based on evidence from few loci, such as Hox genes, with a recent study questioning the validity of these conclusions. Therefore, genome-wide investigations with a diverse taxon sampling may help to answer how many paleoploidization events have taken place in chelicerates.
The CheliPloidy project will investigate the signals of WGD in chelicerates using newly assembled complete genome encompassing most of their diversity. Importantly, no study has considered that return to diploidy may have happened at different intervals (delayed rediploidization), scenario compatible with the different gene histories seen in the group. We will employ multiple state-of-the-art methods and develop novel ones to look for these signals. For example, we will analyse thousands of gene families trees, assess their synteny, and compare signals of divergence among within-species paralogs (including ohnologs derived from the WGD). As the phylogeny of chelicerates is contentious, we will test the most likely scenarios –alternative backbone trees– to polarize patterns of WGD (how many and which are shared). Altogheter, this project will not only sheds light on the complex genome evolution and the phylogeny of chelicerates, but also demonstrates how a combination of comparative methods can be used to infer signals of ancient WGDs.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Die Klassifikation dieses Projekts wurde von Menschen validiert.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
08007 BARCELONA
Spanien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.