Descrizione del progetto
Genomica e intelligenza artificiale per prevedere il rischio di estinzione delle specie
Comprendere perché le specie si estinguono è una questione centrale nella biologia evolutiva e per la conservazione della biodiversità. La lista rossa delle specie minacciate stilata dall’Unione internazionale per la conservazione della natura utilizza fattori quali le dimensioni della popolazione e le minacce esterne per prevedere il tasso di declino e il rischio di estinzione di ciascuna specie. Tuttavia, trascura i fattori genetici che possono fornire informazioni sulla diversità genetica e sulle mutazioni dannose che possono influenzare il rischio di estinzione. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto REVEAL combinerà dati genomici sugli uccelli su larga scala, simulazioni al computer e intelligenza artificiale per scoprire le firme genetiche legate al rischio di estinzione. I ricercatori valuteranno i punti di forza e i limiti dei genomi di riferimento nel prevedere il rischio di estinzione per orientare le strategie di conservazione.
Obiettivo
Understanding species extinction risk is a crucial goal in Evolutionary Biology and a contemporary societal challenge. The standard
method for assessing extinction risk, the IUCN Red List, focuses on external threats and overlooks genetic factors. Despite some weak
and variable correlations, genetic diversity offers insights beyond the Red List, potentially resulting in an underestimation of
extinction risk. Genomic data, generated rapidly through initiatives like the Bird 10,000 Genomes Project, has the potential to
enhance assessments by revealing historical population demography, genetic diversity, and the genetic load of deleterious
mutations. Recently, there has been excitement about the potential of reference genomes in conservation genomics. However, the
actual potential and limitations of single reference genomes in informing conservation strategies remain unexplored. To address this
gap, I propose a comprehensive approach, REVEAL, which integrates comparative genomics and individual-based simulations within
a robust Artificial Intelligence (AI) framework. The proposal comprises three steps: (i) simulating extinction risk using a broad
parameter space with a dataset of at least 3,825 bird genomes generated by the B10K consortium, (ii) training AI models to recognise
genomic signatures associated with extinction risk, based on the previous simulations, and (iii) evaluating the potential and
limitations of single reference genomes for extinction risk assessment, using the trained AI models. In particular, I will focus on avian
species with diverse geographic ranges and ancestral population sizes in order to compare extinction risk predictions, considering
both spatial dynamics and temporal dynamics. REVEAL seeks to move beyond conventional assessments and improve our
understanding of extinction risk evaluation using genomic data, ultimately enhancing our ability to formulate effective species
recovery strategies.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione intelligenza artificiale
- scienze sociali sociologia demografia
- scienze naturali scienze biologiche biologia evoluzionistica
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
1165 KOBENHAVN
Danimarca
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.