Descripción del proyecto
ADN móvil y actividad génica
Los elementos transponibles (ET o TE, por sus siglas en inglés) son secuencias genómicas móviles que constituyen casi la mitad del genoma humano y del ratón. Aunque la mayoría ya no cambia de posición, muchas de estas secuencias han sido reutilizadas por las células como elementos reguladores que controlan la actividad génica. Estas secuencias de doble función pueden tanto favorecer el desarrollo normal como desencadenar efectos nocivos como el cáncer, por lo que su regulación es crucial. En el proyecto TE-DRIVER, que cuenta con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, se pretende comprender cómo funcionan los diferentes ET como promotores génicos y cómo su actividad está influenciada por el entorno genómico que los rodea. Los investigadores estudiarán el papel de la cromatina, la metilación del ADN y la estructura general del genoma en la transcripción promovida por ET. En conjunto, el estudio aportará conocimientos fundamentales sobre la regulación genómica.
Objetivo
"Transposable elements (TEs) make up about half of both the human and mouse genomes, playing a crucial role in genome plasticity and evolution. Most TEs have accumulated mutations that disable their transposition, but even fragmented TEs are often co-opted by the host into complex regulatory systems like promoters, enhancers and silencers, profoundly influencing gene and chromatin regulation. For example, a retrotransposon acts as a promoter to drive the expression of a specific isoform of Cdk2ap1, which is crucial for pre-implantation development. However, TEs can also trigger senescence and oncogene expression, making them a ""double-edged sword"" in biology. Given TEs’s dual role, the activity and regulation of TEs driving downstream transcription is extremely important for cellular homeostasis. Studies have suggested a potential role for TEs as promoters, yet evidence is fragmentary and indirect. The sufficiency of TEs in autonomously driving transcription, their interaction with genomic context, and differences between TEs in various genomic context remain largely unknown. The TE-Driver project aims to systematically and directly investigate TEs transcriptional activity and its regulation by genomic context such as DNA methylation, histone modifications and chromatin structure. TE-Driver will integrate representative TEs (MT2_Mm, L1MdTf_II, and B3A) into thousands of genomic locations in mouse embryonic stem cells (mESCs). TE integration sites will be captured via inverse PCR coupled with high-throughput sequencing, and transcriptome changes will be analyzed using Smart-seq+5’. The project will integrate these datasets with publicly available datasets on genomic context to evaluate TEs sufficiency in driving transcription within genomic contexts and elucidate differences among TEs. TE-Driver aims to advance our understanding of TE mechanisms in genome regulation and contribute to fields such as stem cell biology, developmental biology and functional genomics."
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN transcriptomas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
- ciencias médicas y de la salud medicina básica fisiología homeostasis
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
85764 Neuherberg
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.