Descrizione del progetto
DNA mobile e attività genica
Gli elementi trasponibili sono sequenze genomiche mobili che costituiscono quasi la metà del genoma umano e murino. Sebbene la maggior parte di essi non sia più mobile, molti sono stati riutilizzati dalle cellule come elementi regolatori che controllano l’attività genica. Tali sequenze a doppia funzione possono sia favorire il normale sviluppo che provocare effetti dannosi come il cancro, il che rende fondamentale la loro regolazione. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto TE-DRIVER mira a comprendere come i diversi elementi trasponibili funzionano come promotori genici e come la loro attività sia influenzata dal contesto genomico circostante. I ricercatori studieranno il ruolo della cromatina, della metilazione del DNA e della struttura genomica complessiva sulla trascrizione guidata dagli elementi trasponibili. Nel complesso, lo studio fornirà conoscenze fondamentali sulla regolazione genomica.
Obiettivo
"Transposable elements (TEs) make up about half of both the human and mouse genomes, playing a crucial role in genome plasticity and evolution. Most TEs have accumulated mutations that disable their transposition, but even fragmented TEs are often co-opted by the host into complex regulatory systems like promoters, enhancers and silencers, profoundly influencing gene and chromatin regulation. For example, a retrotransposon acts as a promoter to drive the expression of a specific isoform of Cdk2ap1, which is crucial for pre-implantation development. However, TEs can also trigger senescence and oncogene expression, making them a ""double-edged sword"" in biology. Given TEs’s dual role, the activity and regulation of TEs driving downstream transcription is extremely important for cellular homeostasis. Studies have suggested a potential role for TEs as promoters, yet evidence is fragmentary and indirect. The sufficiency of TEs in autonomously driving transcription, their interaction with genomic context, and differences between TEs in various genomic context remain largely unknown. The TE-Driver project aims to systematically and directly investigate TEs transcriptional activity and its regulation by genomic context such as DNA methylation, histone modifications and chromatin structure. TE-Driver will integrate representative TEs (MT2_Mm, L1MdTf_II, and B3A) into thousands of genomic locations in mouse embryonic stem cells (mESCs). TE integration sites will be captured via inverse PCR coupled with high-throughput sequencing, and transcriptome changes will be analyzed using Smart-seq+5’. The project will integrate these datasets with publicly available datasets on genomic context to evaluate TEs sufficiency in driving transcription within genomic contexts and elucidate differences among TEs. TE-Driver aims to advance our understanding of TE mechanisms in genome regulation and contribute to fields such as stem cell biology, developmental biology and functional genomics."
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA trascrittomi
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
- scienze mediche e della salute medicina di base fisiologia omeostasi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
85764 Neuherberg
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.