Projektbeschreibung
Mobile DNS und Genaktivität
Transposons sind springende genomische Sequenzen, aus denen fast die Hälfte der Genome von Mensch und Maus gebildet sind. Obwohl sich die meisten nicht mehr bewegen, wurden viele von ihnen von den Zellen als regulatorische Elemente zur Steuerung der Genaktivität umfunktioniert. Diese Sequenzen mit doppeltem Verwendungszweck können sowohl die normale Entwicklung unterstützen als auch schädliche Effekte wie etwa Krebs auslösen, weshalb ihre Regulierung von zentraler Wichtigkeit ist. Mit Unterstützung der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen zielt das Team des Projekts TE-DRIVER darauf ab, zu verstehen, wie verschiedene Transposons als Genpromotoren funktionieren und wie ihre Aktivität von ihrer genomischen Umgebung beeinflusst wird. Die Forschenden werden die Funktion des Chromatins, der DNS-Methylierung und der Genomstruktur insgesamt für die durch Transposons gesteuerte Transkription untersuchen. Insgesamt wird die Studie grundlegende Erkenntnisse über die Genomregulierung liefern.
Ziel
"Transposable elements (TEs) make up about half of both the human and mouse genomes, playing a crucial role in genome plasticity and evolution. Most TEs have accumulated mutations that disable their transposition, but even fragmented TEs are often co-opted by the host into complex regulatory systems like promoters, enhancers and silencers, profoundly influencing gene and chromatin regulation. For example, a retrotransposon acts as a promoter to drive the expression of a specific isoform of Cdk2ap1, which is crucial for pre-implantation development. However, TEs can also trigger senescence and oncogene expression, making them a ""double-edged sword"" in biology. Given TEs’s dual role, the activity and regulation of TEs driving downstream transcription is extremely important for cellular homeostasis. Studies have suggested a potential role for TEs as promoters, yet evidence is fragmentary and indirect. The sufficiency of TEs in autonomously driving transcription, their interaction with genomic context, and differences between TEs in various genomic context remain largely unknown. The TE-Driver project aims to systematically and directly investigate TEs transcriptional activity and its regulation by genomic context such as DNA methylation, histone modifications and chromatin structure. TE-Driver will integrate representative TEs (MT2_Mm, L1MdTf_II, and B3A) into thousands of genomic locations in mouse embryonic stem cells (mESCs). TE integration sites will be captured via inverse PCR coupled with high-throughput sequencing, and transcriptome changes will be analyzed using Smart-seq+5’. The project will integrate these datasets with publicly available datasets on genomic context to evaluate TEs sufficiency in driving transcription within genomic contexts and elucidate differences among TEs. TE-Driver aims to advance our understanding of TE mechanisms in genome regulation and contribute to fields such as stem cell biology, developmental biology and functional genomics."
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS Transkriptome
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Mutation
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Physiologie Homöostase
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
85764 Neuherberg
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.