Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Investigating the causal effects of transposable elements on downstream transcription within genomic context

Opis projektu

Ruchome DNA a aktywność genów

Transpozony to ruchome sekwencje genomowe, które stanowią prawie połowę genomu człowieka i myszy. Chociaż większość z nich już się nie porusza, wiele zostało zmienionych przez komórki jako elementy regulacyjne, które kontrolują aktywność genów. Te dwufunkcyjne sekwencje mogą zarówno wspierać normalny rozwój, jak i wywoływać szkodliwe skutki, w tym nowotwory, co czyni ich regulację kluczową. Wspierany przez program działań „Maria Skłodowska-Curie” projekt TE-DRIVER ma na celu ustalenie, w jaki sposób różne transpozonów działają jako promotory genów i jak na ich aktywność wpływa ich otoczenie genomowe. Uczeni zbadają rolę chromatyny, metylacji DNA i ogólnej struktury genomu w transkrypcji TE-drive. Badanie to dostarczy fundamentalnej wiedzy na temat regulacji genomu.

Cel

"Transposable elements (TEs) make up about half of both the human and mouse genomes, playing a crucial role in genome plasticity and evolution. Most TEs have accumulated mutations that disable their transposition, but even fragmented TEs are often co-opted by the host into complex regulatory systems like promoters, enhancers and silencers, profoundly influencing gene and chromatin regulation. For example, a retrotransposon acts as a promoter to drive the expression of a specific isoform of Cdk2ap1, which is crucial for pre-implantation development. However, TEs can also trigger senescence and oncogene expression, making them a ""double-edged sword"" in biology. Given TEs’s dual role, the activity and regulation of TEs driving downstream transcription is extremely important for cellular homeostasis. Studies have suggested a potential role for TEs as promoters, yet evidence is fragmentary and indirect. The sufficiency of TEs in autonomously driving transcription, their interaction with genomic context, and differences between TEs in various genomic context remain largely unknown. The TE-Driver project aims to systematically and directly investigate TEs transcriptional activity and its regulation by genomic context such as DNA methylation, histone modifications and chromatin structure. TE-Driver will integrate representative TEs (MT2_Mm, L1MdTf_II, and B3A) into thousands of genomic locations in mouse embryonic stem cells (mESCs). TE integration sites will be captured via inverse PCR coupled with high-throughput sequencing, and transcriptome changes will be analyzed using Smart-seq+5’. The project will integrate these datasets with publicly available datasets on genomic context to evaluate TEs sufficiency in driving transcription within genomic contexts and elucidate differences among TEs. TE-Driver aims to advance our understanding of TE mechanisms in genome regulation and contribute to fields such as stem cell biology, developmental biology and functional genomics."

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Słowa kluczowe

Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

HELMHOLTZ ZENTRUM MUENCHEN DEUTSCHES FORSCHUNGSZENTRUM FUER GESUNDHEIT UND UMWELT GMBH
Wkład UE netto

Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.

€ 217 965,12
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych
Moja broszura 0 0