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Pinpoint-NMR: A sequence-specific labeling technique to accelerate NMR investigation of large proteins

Projektbeschreibung

Fortgeschrittene NMR-Spektroskopie zur Untersuchung großer Proteinkomplexe

Die Kernspinresonanzspektroskopie (Nuclear magnetic resonance, NMR) ist eine Analysetechnik, die Aufschluss über die Atome und ihre Wechselwirkungen in Molekülen gibt. Forschende nutzen die NMR, um die Struktur von Proteinen zu untersuchen und ihre Funktionsweise bei Gesundheit und Krankheit zu verstehen. Die Untersuchung großer Proteinkomplexe bleibt jedoch aufgrund von Signalüberschneidungen und einer komplizierten Probenvorbereitung eine Herausforderung. Das über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützte Projekt PINPOINT-NMR wird eine innovative Methode zur Markierung spezifischer Stellen in großen Proteinen einführen. Dieser gezielte Ansatz verspricht, die Durchführung von NMR-Spektren zu vereinfachen und die Analyse zu beschleunigen. So wird es einfache, große Biomoleküle wie therapeutische Antikörper zu untersuchen, was der biomedizinische Forschung und Arzneimittelentwicklung zugutekommt.

Ziel

The cell is an ensemble of dynamic molecular machines. NMR spectroscopy is the method of choice to observe complex conformational changes, transient interactions, and dynamics of proteins at atomic resolution. The introduction of methyl-specific labeling has made it possible to study protein assemblies of several hundred kDa by solution NMR. However, the high number of overlapping signals and the labor-intensive process of site specific analysis hamper NMR investigation of large hetero-oligomeric assemblies at room temperature. While segmental labeling or site-specific labeling offer opportunities to simplify 2D NMR spectra, the complexity of sample preparation or the characteristic low expression yield drastically limit its subsequent applications. Therefore, efficient, widely applicable, and straightforward labeling strategies are necessary to integrate solution NMR analysis of large proteins (such as monoclonal antibodies) into R&D pipelines for biomedical industry. I propose to harness the natural (anti)codon code for multi-site, sequence-specific isotope labeling. The resulting method would simplify the spectral congestion typical of 2D NMR spectra of large proteins, allowing targeted investigation of sites of interest (e.g. catalytic centers) and streamlining residue assignment. This method will reduce the time required for residue specific analysis of NMR data from months to days, thus expanding our ability to study large, medically-relevant complexes and address current biological challenges.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

Schlüsselbegriffe

Programm/Programme

Thema/Themen

Finanzierungsplan

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

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Koordinator

UNIVERSITE GRENOBLE ALPES
Netto-EU-Beitrag
€ 283 025,70
Adresse
621 AVENUE CENTRALE
38058 Grenoble
Frankreich
Region
Auvergne-Rhône-Alpes Rhône-Alpes Isère
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten
Keine Daten

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