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Pinpoint-NMR: A sequence-specific labeling technique to accelerate NMR investigation of large proteins

Descrizione del progetto

Spettroscopia NMR avanzata per lo studio di grandi complessi proteici

La spettroscopia di risonanza magnetica nucleare (NMR) è una tecnica analitica che rivela gli atomi e la loro interazione all’interno delle molecole. I ricercatori si affidano alla NMR per esaminare la struttura delle proteine e comprenderne la funzione nella salute e nella malattia. Tuttavia, lo studio di grandi complessi proteici rimane difficile a causa della sovrapposizione dei segnali e della complessa preparazione dei campioni. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto PINPOINT-NMR introduce un metodo innovativo per etichettare siti specifici all’interno di grandi proteine. Questo approccio mirato promette di semplificare gli spettri NMR e di accelerare l’analisi. Di conseguenza, sarà più facile studiare biomolecole di grandi dimensioni come gli anticorpi terapeutici, sostenendo la ricerca biomedica e lo sviluppo di farmaci.

Obiettivo

The cell is an ensemble of dynamic molecular machines. NMR spectroscopy is the method of choice to observe complex conformational changes, transient interactions, and dynamics of proteins at atomic resolution. The introduction of methyl-specific labeling has made it possible to study protein assemblies of several hundred kDa by solution NMR. However, the high number of overlapping signals and the labor-intensive process of site specific analysis hamper NMR investigation of large hetero-oligomeric assemblies at room temperature. While segmental labeling or site-specific labeling offer opportunities to simplify 2D NMR spectra, the complexity of sample preparation or the characteristic low expression yield drastically limit its subsequent applications. Therefore, efficient, widely applicable, and straightforward labeling strategies are necessary to integrate solution NMR analysis of large proteins (such as monoclonal antibodies) into R&D pipelines for biomedical industry. I propose to harness the natural (anti)codon code for multi-site, sequence-specific isotope labeling. The resulting method would simplify the spectral congestion typical of 2D NMR spectra of large proteins, allowing targeted investigation of sites of interest (e.g. catalytic centers) and streamlining residue assignment. This method will reduce the time required for residue specific analysis of NMR data from months to days, thus expanding our ability to study large, medically-relevant complexes and address current biological challenges.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

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Coordinatore

UNIVERSITE GRENOBLE ALPES
Contributo netto dell'UE
€ 283 025,70
Indirizzo
621 AVENUE CENTRALE
38058 Grenoble
Francia
Regione
Auvergne-Rhône-Alpes Rhône-Alpes Isère
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato

Partner (2)