Descripción del proyecto
Caracterización funcional de la fosforilación de proteínas
Si bien la fosfoproteómica ha facilitado la cuantificación de la fosforilación de proteínas, caracterizar los resultados funcionales de los eventos de fosforilación sigue siendo un desafío. El equipo del proyecto DOMAIN-PHOS, financiado por las Acciones Marie Skłodowska-Curie, tiene como objetivo establecer un método de alto rendimiento para caracterizar las funciones bioquímicas de los eventos de fosforilación. Dado que varios dominios proteicos reconocen la fosforilación de otras proteínas, se definirán tanto las funciones del aglutinante como las del fosfosustrato. Por ejemplo, treinta y siete proteínas humanas comprenden el dominio «Forkhead-Associated» (FHA) de unión al fósforo, cada una con diferencias sutiles en la secuencia que influyen en la elección del sustrato. Por lo tanto, el método consiste en marcar todos los dominios FHA con proteína verde fluorescente para su uso en ensayos de «pulldown» por afinidad, seguido de espectrometría de masas para el análisis comparativo de los sustratos fosforados. Los resultados se validarán mediante «pulldowns» recíprocos de fosfopéptidos a gran escala.
Objetivo
In recent decades, phosphoproteomics has greatly advanced our ability to quantify protein phosphorylation. However, characterizing the functional consequences of these phosphorylation events remains challenging, with only ~6% of recorded events having an associated function. This project aims to bridge this gap by developing a high-throughput method for characterizing biochemical functions of phospho-events.
The proposed approach, supported by preliminary data, leverages the fact that some protein domains recognize phosphorylation of other proteins, thereby defining the function of both the binder and the phospho-substrate. For example, 37 human proteins contain the phospho-binding Forkhead-Associated (FHA) domain, each with a slightly altered sequence influencing substrate choice. FHA proteins act in various processes, including DNA damage response and cytoskeletal movements, areas of expertise for the applicant.
The project involves GFP-tagging all human FHA domains for use in affinity pulldowns, followed by mass spectrometry for comparative analysis of phospho-substrates. For validation, we will perform large-scale reciprocal phosphopeptide pulldowns, a technique developed in the host lab. The combination of the applicant's expertise and the host lab's methodology creates a strong synergy. To understand structure-function relations, we will model interactions of shortlisted FHA:phospho-substrate pairs using AlphaFold3. Additionally, we will conduct phenome-wide association studies to find links between mutations in interaction pairs and disease states, including the functional follow-up on disease-relevant findings.
The appeal of this approach extends beyond expanding FHA domain biology, as it has the potential to generalize to other post-translational modification- (PTM-) binding domains. This method could start a field describing PTM-associated functions at scale, enabling easier causative linking of protein function, mutation, and disease.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1165 KOBENHAVN
Dinamarca
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.