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Decoding the transcriptomic programs that define human macrophage function.

Projektbeschreibung

Die genetische Regulation der Makrophagenfunktionsstörung bei chronischer Entzündung entschlüsseln

Makrophagen sind essentielle Immunzellen, die eine zentrale Rolle bei der Regulation von Entzündungen und der Gewebehomöostase spielen. Die Forschung hat gezeigt, dass fehlegulierte Makrophagen einen erheblichen Einfluss auf chronische Entzündungen haben, obgleich die molekularen Mechanismen hinter diesem Verhalten unklar sind. Das mit Unterstützung durch das Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmenprogramm unterstützte Projekt MACROCODE möchte die Mechanismen erforschen, die zu einer veränderten Funktion von Makrophagen während chronischer Entzündungen führen. Dazu werden Gene in Makrophagen, die bei chronischen Entzündungszuständen eine fehlregulierte Expression aufweisen, manipuliert und ein rechnergestützter Framework entwickelt, um diese manipulierten Gene mit Transkriptomprogrammen, zellulären Funktionen und Krankheitsphänotypen in Verbindung zu setzen. Schließlich werden wichtige Gene validiert, indem ihre Expression moduliert wird, um die Auswirkungen auf die Differenzierung, Identität und Funktion von Makrophagen zu bewerten.

Ziel

Macrophages are essential cells of the innate immune system, playing crucial roles in coordinating inflammatory responses and maintaining homeostasis. In cases of chronic inflammation, damaged tissues release abnormal signals that attract macrophages precursors to the local environment and drive macrophages toward a proinflammatory phenotype. This creates a feedback loop that sustains inflammation. The consequences to society are huge: chronic inflammatory diseases are among the leading causes of death and disability worldwide.

Recent single-cell multi-omics studies have identified dysregulated macrophages as central players in chronic inflammation, but the molecular mechanisms sustaining these responses remain poorly understood.

MACROCODE aims to unravel the molecular mechanisms governing the altered function of macrophages during chronic inflammation.

The specific aims of this project are:

1. Use CRISPR-Cas9 technology with single-cell read-outs to perturb genes in macrophages that show dysregulated expression between healthy and diseased states in chronic inflammatory conditions . Genes will be selected by creating an integrated single-cell transcriptomics atlas of macrophages in both health and disease.

2. Develop a computational framework using bioinformatics and AI tools to link these perturbed genes to transcriptomic programs, cellular functions and in vivo disease phenotypes.

3. Validate key genes by modulating their expression using dCas9-VPR or KRAB systems, and evaluate the effects on macrophage differentiation, identity and function.

Altogether, MACROCODE will decode the genetic regulation of macrophage dysfunction in chronic inflammation. This multidisciplinary project will equip me with advanced skills in genomics and bioinformatics, enhance my leadership and transferable skills, and prepare me for a future as an independent leader in the field of gene therapy for immune diseases.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

GENOME RESEARCH LIMITED LBG
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 260 347,92
Adresse
WELLCOME SANGER INSTITUTE WELLCOME GENOME CAMPUS HINXTON
CB10 1SA SAFFRON WALDEN
Vereinigtes Königreich

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Region
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0