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Decoding the transcriptomic programs that define human macrophage function.

Descrizione del progetto

Decifrare la regolazione genetica della disfunzione dei macrofagi nell’infiammazione cronica

I macrofagi sono cellule immunitarie essenziali che svolgono un ruolo chiave nella regolazione dell’infiammazione e nell’omeostasi dei tessuti. La ricerca ha rivelato che i macrofagi disregolati influenzano significativamente l’infiammazione cronica, ma i meccanismi molecolari alla base di questo comportamento non sono chiari. Supportato dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto MACROCODE si propone di individuare i meccanismi che alterano la funzione dei macrofagi durante l’infiammazione cronica. Per fare ciò, perturberà i geni nei macrofagi che mostrano un’espressione disregolata nelle condizioni infiammatorie croniche e svilupperà un quadro computazionale per collegare questi geni perturbati ai programmi trascrittomici, alle funzioni cellulari e ai fenotipi della malattia. Infine, validerà i geni chiave modulandone l’espressione per valutare l’impatto sulla differenziazione, l’identità e la funzione dei macrofagi.

Obiettivo

Macrophages are essential cells of the innate immune system, playing crucial roles in coordinating inflammatory responses and maintaining homeostasis. In cases of chronic inflammation, damaged tissues release abnormal signals that attract macrophages precursors to the local environment and drive macrophages toward a proinflammatory phenotype. This creates a feedback loop that sustains inflammation. The consequences to society are huge: chronic inflammatory diseases are among the leading causes of death and disability worldwide.

Recent single-cell multi-omics studies have identified dysregulated macrophages as central players in chronic inflammation, but the molecular mechanisms sustaining these responses remain poorly understood.

MACROCODE aims to unravel the molecular mechanisms governing the altered function of macrophages during chronic inflammation.

The specific aims of this project are:

1. Use CRISPR-Cas9 technology with single-cell read-outs to perturb genes in macrophages that show dysregulated expression between healthy and diseased states in chronic inflammatory conditions . Genes will be selected by creating an integrated single-cell transcriptomics atlas of macrophages in both health and disease.

2. Develop a computational framework using bioinformatics and AI tools to link these perturbed genes to transcriptomic programs, cellular functions and in vivo disease phenotypes.

3. Validate key genes by modulating their expression using dCas9-VPR or KRAB systems, and evaluate the effects on macrophage differentiation, identity and function.

Altogether, MACROCODE will decode the genetic regulation of macrophage dysfunction in chronic inflammation. This multidisciplinary project will equip me with advanced skills in genomics and bioinformatics, enhance my leadership and transferable skills, and prepare me for a future as an independent leader in the field of gene therapy for immune diseases.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

GENOME RESEARCH LIMITED LBG
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 260 347,92
Indirizzo
WELLCOME SANGER INSTITUTE WELLCOME GENOME CAMPUS HINXTON
CB10 1SA SAFFRON WALDEN
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Regione
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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