Projektbeschreibung
Genomfaltung und Gentranskription
Die Transkription, der Prozess des Kopierens von DNA in RNA, wird an Promotoren eingeleitet, DNA-Elementen, die die Transkriptionsmaschinerie rekrutieren. Die Geschwindigkeit und Spezifität der Transkription wird durch Enhancer erhöht, distale regulatorische DNA-Elemente, die als Knotenpunkte für Transkriptionsfaktoren und Koaktivatoren dienen. Trotz jahrelanger Untersuchungen ist nach wie vor unklar, ob die Zusammenarbeit zwischen Promotor und Enhancer eine instruktive Rolle bei der Transkription spielt. Das über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützte Projekt DynaMitE wird die Rolle dieser Elemente während des Übergangs von der Mitose zur Interphase untersuchen, wenn sich das Chromatin neu organisiert und die Genexpression zurückgesetzt wird. Die Forschenden werden Live-Bildgebung und Genom-Engineering einsetzen, um zu beobachten, wie die Faltung des Genoms die Reaktivierung der Transkription beeinflusst.
Ziel
In spite of intense investigations, it remains unclear whether and how the interaction between promoters and distant enhancers has an instructive role in transcription. I will tackle this question by tracking the spatial and temporal dynamics of gene regulatory sequences alongside nascent transcription during the critical biological event that is the mitosis-to-interphase transition in live cells. During mitosis, chromatin undergoes a massive reorganization, resulting in the loss of long-range interactions, the displacement of transcription factors, and a global reduction in transcription. The re-establishment of interphase gene expression programs is essential for the maintenance (or a chance for the change) of cell identity; however, the molecular mechanism of such re-establishment is an unsolved biological problem. Previous studies, largely relying on fixed cells and next-generation sequencing technologies, have not captured the dynamic nature of these events. I will use state-of-the-art genome engineering and live imaging technologies in proliferating mouse embryonic stem cells to simultaneously monitor the movement of regulatory sequences and the re-initiation of transcription at key pluripotency genes at the exit from mitosis, as well as test the role of mitotically-retained transcription factors. This project, termed DynaMitE, will address the burning question of how genome folding influences transcription within a physiological context of transcription re-activation, and will uncover mechanistic insights into the restoration of interphase gene expression with unparalleled temporal resolution in single cells.
Importantly, by achieving the objectives of DynaMitE within the host laboratory, I will complement my expertise in genomics and developmental biology with advanced skills in cutting edge microscopy, image analysis and a biophysical lens on gene regulation, shaping the profile of the future group leader I aspire to be.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Naturwissenschaften Optik Mikroskopie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
75724 Paris
Frankreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.