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Illuminating the dynamics of transcription and chromatin at the exit from mitosis

Descrizione del progetto

Ripiegamento del genoma e trascrizione genica

La trascrizione, il processo di copiatura del DNA in RNA, viene avviata dai promotori, elementi del DNA che reclutano il macchinario di trascrizione. La velocità e la specificità della trascrizione sono aumentate dagli enhancer, elementi regolatori distali del DNA che fungono da hub per i fattori di trascrizione e i co-attivatori. Nonostante anni di ricerche, non è ancora chiaro se la cooperazione promotore-enhancer svolga un ruolo istruttivo nella trascrizione. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto DynaMitE studierà il ruolo di questi elementi durante la transizione dalla mitosi alla interfase, quando la cromatina si riorganizza e l’espressione genica viene reimpostata. I ricercatori utilizzeranno l’imaging dal vivo e l’ingegneria del genoma per monitorare come il ripiegamento del genoma influenza la riattivazione della trascrizione.

Obiettivo

In spite of intense investigations, it remains unclear whether and how the interaction between promoters and distant enhancers has an instructive role in transcription. I will tackle this question by tracking the spatial and temporal dynamics of gene regulatory sequences alongside nascent transcription during the critical biological event that is the mitosis-to-interphase transition in live cells. During mitosis, chromatin undergoes a massive reorganization, resulting in the loss of long-range interactions, the displacement of transcription factors, and a global reduction in transcription. The re-establishment of interphase gene expression programs is essential for the maintenance (or a chance for the change) of cell identity; however, the molecular mechanism of such re-establishment is an unsolved biological problem. Previous studies, largely relying on fixed cells and next-generation sequencing technologies, have not captured the dynamic nature of these events. I will use state-of-the-art genome engineering and live imaging technologies in proliferating mouse embryonic stem cells to simultaneously monitor the movement of regulatory sequences and the re-initiation of transcription at key pluripotency genes at the exit from mitosis, as well as test the role of mitotically-retained transcription factors. This project, termed DynaMitE, will address the burning question of how genome folding influences transcription within a physiological context of transcription re-activation, and will uncover mechanistic insights into the restoration of interphase gene expression with unparalleled temporal resolution in single cells.
Importantly, by achieving the objectives of DynaMitE within the host laboratory, I will complement my expertise in genomics and developmental biology with advanced skills in cutting edge microscopy, image analysis and a biophysical lens on gene regulation, shaping the profile of the future group leader I aspire to be.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

INSTITUT PASTEUR
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 226 420,56
Indirizzo
RUE DU DOCTEUR ROUX 25-28
75724 Paris
Francia

Mostra sulla mappa

Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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