Projektbeschreibung
Bakterielle Abwehr und Plasmid-Evolution
Plasmide sind kleine zirkuläre DNS-Moleküle, die in Bakterien vorkommen und oft Antibiotikaresistenzgene tragen. Das Verständnis, wie sich Plasmide zwischen Bakterien bewegen, ist daher entscheidend für die Bekämpfung der Antibiotikaresistenz. Bakterien verfügen über ein breites Spektrum natürlicher Abwehrsysteme, die eindringende Viren und in einigen Fällen auch eindringende Plasmide blockieren. Die große Zahl und Vielfalt solcher Systeme erschwert jedoch ihre experimentelle Prüfung. Das vom Europäischen Forschunhgsrat finanzierte Projekt PLEIADES soll erforschen, wie bakterielle Abwehrmechanismen die Plasmidevolution beeinflussen. Durch die Verbindung von Computeranalyse und Evolutionstheorie wird das Projekt untersuchen, wie sich Abwehrsysteme auf die Plasmidvielfalt, den genetischen Inhalt und den Wettbewerb innerhalb mikrobieller Gemeinschaften auswirken.
Ziel
Plasmids are self-copying genetic elements that can move between bacterial species. They frequently carry antimicrobial resistance (AMR) genes, making understanding the factors that affect their spread through bacterial communities an urgent challenge. Exploiting bacteria’s natural defence systems to block plasmid spread is an exciting possibility. Recent years have seen a huge increase in the known number of ‘anti-phage’ systems that stop bacterial viruses (phage) from gaining a foothold in the cell. Some of these systems also defend against incoming plasmids, but the pace of discovery has outstripped the ability to experimentally test all relationships. We need computational approaches: by developing new methods, PLEIADES will bridge the gap and give us new insights into plasmid evolution.
The central hypothesis of PLEIADES is that selective pressure from ‘anti-phage’ defence systems also shapes the genomic architecture of plasmids. To better understand plasmid evolution we need to explore how variation in plasmid content and structure is linked to defence systems. We will tackle three objectives. First, we will build statistical models that relate the diversity of defence systems and plasmids across bacteria, controlling for other factors to deliver a systematic understanding of their relationship. Second, we will investigate the modular evolution of plasmids, which evolve by frequent rearrangements, using new computational frameworks that capture this plasticity together with tools to predict functions for plasmid proteins (the majority of which are currently unknown). Third, we will explore the role of defence systems in plasmid competition, investigating diverse plasmids from metagenomes to build a data-driven theory of their coevolutionary dynamics.
By combining cutting-edge computational analysis with evolutionary theory, PLEIADES will advance our understanding of plasmid evolution, paving the way for new experimental efforts to address the threat of AMR.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Bakteriologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Virologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2025-STG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
BS8 1QU BRISTOL
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.