Descrizione del progetto
Difesa batterica ed evoluzione dei plasmidi
I plasmidi sono piccole molecole circolari di DNA che si trovano nei batteri e spesso trasportano geni di resistenza agli antibiotici. Capire come i plasmidi si spostano tra i batteri è quindi fondamentale per affrontare la resistenza antimicrobica. I batteri possiedono un’ampia gamma di sistemi di difesa naturali che bloccano i virus invasori e, in alcuni casi, i plasmidi in arrivo. Tuttavia, il gran numero e la diversità di questi sistemi ne impediscono la verifica sperimentale. Il progetto PLEIADES, finanziato dal CER, si propone di indagare come i meccanismi di difesa batterica influenzino l’evoluzione dei plasmidi. Combinando l’analisi computazionale e la teoria evolutiva, il progetto studierà come i sistemi di difesa influenzino la diversità dei plasmidi, il contenuto genetico e la competizione all’interno delle comunità microbiche.
Obiettivo
Plasmids are self-copying genetic elements that can move between bacterial species. They frequently carry antimicrobial resistance (AMR) genes, making understanding the factors that affect their spread through bacterial communities an urgent challenge. Exploiting bacteria’s natural defence systems to block plasmid spread is an exciting possibility. Recent years have seen a huge increase in the known number of ‘anti-phage’ systems that stop bacterial viruses (phage) from gaining a foothold in the cell. Some of these systems also defend against incoming plasmids, but the pace of discovery has outstripped the ability to experimentally test all relationships. We need computational approaches: by developing new methods, PLEIADES will bridge the gap and give us new insights into plasmid evolution.
The central hypothesis of PLEIADES is that selective pressure from ‘anti-phage’ defence systems also shapes the genomic architecture of plasmids. To better understand plasmid evolution we need to explore how variation in plasmid content and structure is linked to defence systems. We will tackle three objectives. First, we will build statistical models that relate the diversity of defence systems and plasmids across bacteria, controlling for other factors to deliver a systematic understanding of their relationship. Second, we will investigate the modular evolution of plasmids, which evolve by frequent rearrangements, using new computational frameworks that capture this plasticity together with tools to predict functions for plasmid proteins (the majority of which are currently unknown). Third, we will explore the role of defence systems in plasmid competition, investigating diverse plasmids from metagenomes to build a data-driven theory of their coevolutionary dynamics.
By combining cutting-edge computational analysis with evolutionary theory, PLEIADES will advance our understanding of plasmid evolution, paving the way for new experimental efforts to address the threat of AMR.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia batteriologia
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia virologia
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-STG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
BS8 1QU BRISTOL
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.