Opis projektu
Obrona bakterii i ewolucja plazmidów
Plazmidy to małe koliste cząsteczki DNA występujące w komórkach bakterii, które często zawierają geny oporności na antybiotyki. Zrozumienie sposobu przemieszczania się plazmidów między bakteriami ma zatem kluczowe znaczenie dla zwalczania oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe. Bakterie dysponują szeroką gamą naturalnych systemów obronnych, które blokują inwazję wirusów, a w niektórych przypadkach także plazmidów. Duża liczba i różnorodność takich systemów utrudnia ich badanie w ramach doświadczeń. Zespół finansowanego ze środków Europejskiej Rady ds. Badań Naukowych projektu PLEIADES ma na celu zbadanie, w jaki sposób bakteryjne mechanizmy obronne wpływają na ewolucję plazmidów. Łącząc analizę obliczeniową i teorię ewolucji badacze przeanalizują wpływ systemów obronnych na różnorodność plazmidów, treść genetyczną i konkurencję w społecznościach drobnoustrojów.
Cel
Plasmids are self-copying genetic elements that can move between bacterial species. They frequently carry antimicrobial resistance (AMR) genes, making understanding the factors that affect their spread through bacterial communities an urgent challenge. Exploiting bacteria’s natural defence systems to block plasmid spread is an exciting possibility. Recent years have seen a huge increase in the known number of ‘anti-phage’ systems that stop bacterial viruses (phage) from gaining a foothold in the cell. Some of these systems also defend against incoming plasmids, but the pace of discovery has outstripped the ability to experimentally test all relationships. We need computational approaches: by developing new methods, PLEIADES will bridge the gap and give us new insights into plasmid evolution.
The central hypothesis of PLEIADES is that selective pressure from ‘anti-phage’ defence systems also shapes the genomic architecture of plasmids. To better understand plasmid evolution we need to explore how variation in plasmid content and structure is linked to defence systems. We will tackle three objectives. First, we will build statistical models that relate the diversity of defence systems and plasmids across bacteria, controlling for other factors to deliver a systematic understanding of their relationship. Second, we will investigate the modular evolution of plasmids, which evolve by frequent rearrangements, using new computational frameworks that capture this plasticity together with tools to predict functions for plasmid proteins (the majority of which are currently unknown). Third, we will explore the role of defence systems in plasmid competition, investigating diverse plasmids from metagenomes to build a data-driven theory of their coevolutionary dynamics.
By combining cutting-edge computational analysis with evolutionary theory, PLEIADES will advance our understanding of plasmid evolution, paving the way for new experimental efforts to address the threat of AMR.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia bakteriologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia wirusologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2025-STG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
BS8 1QU BRISTOL
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.