Descrizione del progetto
Un nuovo meccanismo di omeostasi proteica
Le cellule regolano costantemente la stabilità dei loro mRNA per mettere a punto la produzione di proteine. Le vie classiche si basano su fattori che legano l’RNA, ma un meccanismo recentemente scoperto, noto come decadimento dell’mRNA mediato da peptidi (PMD, Peptide-Mediated Decay), collega la degradazione dell’mRNA direttamente alla proteina nascente che viene sintetizzata. Questo garantisce che l’eccesso di proteine inneschi la distruzione selettiva della propria trascrizione attraverso fattori che riconoscono il polipeptide emergente. I difetti del PMD possono interrompere la divisione cellulare e lo sviluppo neurologico, e le prime evidenze indicano che potrebbero anche regolare le trascrizioni che codificano le proteine soggette ad aggregazione. Il progetto DECODE-PMD, finanziato dal CER, decifrerà il modo in cui i peptidi nascenti avviano il decadimento. L’identificazione dei fattori fisiologici scatenanti e dei bersagli dei PMD a livello genomico contribuirà a stabilire un nuovo paradigma per l’omeostasi proteica.
Obiettivo
Cells tightly regulate mRNA stability to ensure accurate gene expression across diverse cellular states and conditions. Traditionally, selective mRNA degradation has been attributed to the recognition of nucleotide sequence elements by proteins or small RNAs that subsequently recruit decay factors. Conversely, an emerging mechanism termed “peptide-mediated mRNA decay” (PMD) involves the encoded protein: my postdoctoral work revealed how the nascent polypeptide—physically linked to the mRNA during translation by the ribosome—can direct mRNA decay. This process is exemplified by tubulin mRNAs, which are selectively degraded when cells sense excess free tubulin levels. In this novel type of regulation, a recognition factor binds the nascent polypeptide to recruit downstream factors that trigger mRNA degradation. Impaired tubulin PMD results in severe phenotypes like defects in cell division and neurodevelopment. Beyond tubulins, emerging evidence points to critical PMD mechanisms targeting transcripts encoding aggregation-prone proteins. I postulate that PMD represents an entirely unexplored paradigm of gene regulation that dynamically adjusts protein production to ensure cellular fitness. However, the mechanistic understanding of PMD is still limited and the full range of substrates remains unknown.
In DECODE-PMD I will unravel how nascent polypeptides direct mRNA degradation on ribosomes and chart the transcriptome-wide map of PMD substrates. Specifically, I aim to (1) decode how mRNA translation and degradation are coupled during tubulin PMD using a biochemical reconstitution approach; (2) decipher the physiological triggers of tubulin PMD and its regulation; and (3) harness advanced sequencing methods to systematically identify PMD substrates and derive common mechanistic principles. Our innovative work will provide a conceptual framework for how cells exploit nascent polypeptide recognition for selective tuning of mRNA stability to maintain protein homeostasis.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze mediche e della salute medicina di base fisiologia omeostasi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-STG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
08003 Barcelona
Spagna
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.