Description du projet
Conception de protéines qui se lient aux acides nucléiques
Les protéines qui lient les acides nucléiques tels que l’ADN ou l’ARN contrôlent les processus cellulaires, et leur dysfonctionnement peut provoquer des maladies telles que le cancer et l’auto-immunité. Malheureusement, ces interactions sont difficiles à cibler avec des médicaments conventionnels, car leurs surfaces de contact sont vastes et complexes. Le projet NAMPify, financé par le CER, vise à créer une nouvelle catégorie d’outils à base de protéines qui imitent les acides nucléiques et peuvent réguler avec précision les protéines se liant aux acides nucléiques. Les chercheurs développeront des méthodes informatiques avancées pour la conception de ces protéines, en tenant compte de la structure et de la chimie des acides nucléiques. Ces méthodes permettront également de mieux comprendre la structure des complexes protéine-acide nucléique, avec des applications potentielles en médecine.
Objectif
Protein–nucleic acid (NA) interactions are fundamental to many cellular processes, and their disruption can lead to diseases such as autoimmune disorders and cancer. However, targeting NA-binding proteins with small molecules is difficult due to the “undruggable” nature of their interfaces. Recent advancements in computational protein design and deep learning have created new opportunities for the development of protein-based therapeutics. However, current methods struggle to design proteins that can effectively modulate or mimic the intricate protein-NA interactions directly. While some NA-aware models have been developed, they often underperform due to our limited understanding of protein-NA interactions and the scarcity of diverse structural training data. To overcome these challenges, I propose to pioneer the design of NA-mimicking proteins (NAMPs) capable of directly modulating protein-NA interactions with high specificity and adaptable functionality. I will develop computational methods that incorporate the structural and chemical features of NAs, and create NAMPs tailored to engage therapeutically relevant NA-binding proteins and regulate their activity. In addition, I will develop approaches to expand the structural data on protein-NA complexes using accelerated structure determination methods to refine NA-aware models. This will enable the design of NA-binding proteins with sequence- and shape-specific recognition. Lastly, to create molecular machines with complex functionalities, I will develop new methodologies for the de novo design of multi-domain proteins capable of adopting multiple, defined conformations—long considered a “holy grail” in protein design. By integrating these approaches, I aim to overcome the current limitations in studying and designing protein-NA interactions, paving the way for the creation of sophisticated molecular tools with vast applications in synthetic biology, biotechnology, and medicine.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
8006 Zurich
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.