Descrizione del progetto
Progettazione di proteine che si legano agli acidi nucleici
Le proteine che legano gli acidi nucleici come il DNA o l’RNA controllano i processi cellulari, e il loro malfunzionamento può causare malattie come il cancro e l’autoimmunità. Sfortunatamente, queste interazioni sono difficili da bersagliare con i farmaci convenzionali perché le loro superfici di contatto sono ampie e complesse. Il progetto NAMPify, finanziato dal CER, si propone di creare una nuova classe di strumenti basati su proteine che imitano gli acidi nucleici e possono regolare con precisione le proteine che legano gli acidi nucleici. La ricerca svilupperà metodi computazionali avanzati per la progettazione di tali proteine, tenendo conto della struttura e della chimica degli acidi nucleici. Questi metodi forniranno anche informazioni sulla struttura dei complessi proteina-acido nucleico, con potenziali applicazioni in medicina.
Obiettivo
Protein–nucleic acid (NA) interactions are fundamental to many cellular processes, and their disruption can lead to diseases such as autoimmune disorders and cancer. However, targeting NA-binding proteins with small molecules is difficult due to the “undruggable” nature of their interfaces. Recent advancements in computational protein design and deep learning have created new opportunities for the development of protein-based therapeutics. However, current methods struggle to design proteins that can effectively modulate or mimic the intricate protein-NA interactions directly. While some NA-aware models have been developed, they often underperform due to our limited understanding of protein-NA interactions and the scarcity of diverse structural training data. To overcome these challenges, I propose to pioneer the design of NA-mimicking proteins (NAMPs) capable of directly modulating protein-NA interactions with high specificity and adaptable functionality. I will develop computational methods that incorporate the structural and chemical features of NAs, and create NAMPs tailored to engage therapeutically relevant NA-binding proteins and regulate their activity. In addition, I will develop approaches to expand the structural data on protein-NA complexes using accelerated structure determination methods to refine NA-aware models. This will enable the design of NA-binding proteins with sequence- and shape-specific recognition. Lastly, to create molecular machines with complex functionalities, I will develop new methodologies for the de novo design of multi-domain proteins capable of adopting multiple, defined conformations—long considered a “holy grail” in protein design. By integrating these approaches, I aim to overcome the current limitations in studying and designing protein-NA interactions, paving the way for the creation of sophisticated molecular tools with vast applications in synthetic biology, biotechnology, and medicine.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
È necessario effettuare l’accesso o registrarsi per utilizzare questa funzione
Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo programma
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-STG
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bandoIstituzione ospitante
Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
8006 Zurich
Svizzera
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.