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Information flow in developmental cell fate patterning

Projektbeschreibung

Entschlüsseln, wie Zellen mit Störungen umgehen, um über ihr Schicksal zu entscheiden

Wie entwickeln sich Embryonen zu organisierten Strukturen, wenn einzelne Zellen naturgemäß „unruhig“ und unberechenbar sind? Das ERC-finanzierte Projekt InfoFate will diese Frage beantworten, indem es untersucht, wie diese Zellen gemeinsam Informationen verarbeiten, um verlässliche räumliche Muster zu erzeugen. Mithilfe der Informationstheorie und der Computermodellierung soll ermittelt werden, wie Zellen verschiedene Inputs wie chemische Signale von ihren Nachbarn oder die physikalischen Kräfte des umgebenden Gewebes gewichten. Indem sie diese Wechselwirkungen in im Labor gezüchteten Organoiden untersuchen, können die Forschenden die Regeln ermitteln, die es einem unruhigen System ermöglichen, ein perfekt strukturiertes Gewebe zu erzeugen. Diese Forschungsarbeit geht über die einfache Beobachtung hinaus und quantifiziert den tatsächlichen Entscheidungsprozess, der die frühesten Lebensphasen steuert.

Ziel

Embryonic development relies on the ability of multi-cellular systems to collectively coordinate the establishment of precise spatial patterns of cell fates. An inevitable obstacle to such coordination is intrinsic noise at the single-cell level, which constrains the amount of information accessible to cells for fate decisions. While such information was often considered to be encoded in overall concentrations of extracellular signals, it is becoming increasingly clear that cells use a much broader set of inputs to make decisions. In this project, we will develop a new data-driven theoretical framework of developmental patterning to quantify, characterize and predict how cells generate and process four types of information: dynamical signals, neighborhood interactions, tissue heterogeneity, and mechanical information. We will establish a novel theoretical methodology by uniting computational tissue models that account for single-cell noise with information theory to bridge the scales and relate mechano-chemical inputs to cell fate decisions. We will develop this approach in direct connection with spatio-temporal imaging experiments in two model systems. First, we will determine how regulatory interactions in 2D human gastruloids generate information encoded in complex signaling dynamics, and how single cells can use this information to decide their fate. Second, we will reveal how signaling and mechanics interplay to establish mechano-chemical information in intestinal organoids, driving simultaneous fate patterning and tissue morphogenesis. This project will uncover how cell-cell interactions establish self-organized spatial patterns that relay information accessible to single cells to reliably instruct cell fate decisions, and give insight into the fundamental constraints under which developmental systems operate.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2025-STG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

UNIVERSITAT BASEL
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 1 498 051,00
Adresse
PETERSPLATZ 1
4051 Basel
Schweiz

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Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Nordwestschweiz Basel-Stadt
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 1 498 051,00

Begünstigte (1)

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