Projektbeschreibung
Skalierbare genealogische und statistische Methoden zur Genomanalyse
Große Gesundheits- und Genetikstudien enthalten mittlerweile Genom-, Gesundheits- und Umweltdaten von Millionen Menschen, was große rechnerische und statistische Herausforderungen mit sich bringt. Das Team des ERC-finanzierten Projekts ARGgen wird skalierbare Methoden entwickeln, um diese Datensätze effizienter und genauer analysieren zu können. Es wird groß angelegte genealogische Graphen rekonstruieren, um evolutionäre Beziehungen zwischen modernen und alten Genomen darzustellen und diese zur Verbesserung genomischer Analysen, zur Modellierung der genetischen Abstammung und zur Erforschung der Evolutionsgeschichte des Menschen zu nutzen. Das Projektteam wird außerdem Methoden des maschinellen Lernens entwickeln, um Informationen über biologische Funktionen aus Genomdaten zu extrahieren, multiple Merkmale und Abstammungen zu analysieren sowie biobankübergreifende Analysen zu unterstützen. Diese Methoden werden als hochwertige quelloffene Software veröffentlicht und ermöglichen es den Forschungsgruppen, immer größere und vielfältigere Genomdatensätze zu analysieren.
Ziel
Biobank datasets, containing genomic, environmental, and health data for millions of individuals, have provided insights into disease susceptibility, biological mechanisms, and human evolution, facilitating applications such as drug development and genetic risk prediction. However, these datasets present significant challenges: processing their large volumes is computationally very demanding, and modeling the heterogeneity they contain poses substantial statistical obstacles. These issues risk leaving genomic datasets underutilized or amplifying existing biases, such as those linked to genetic ancestry.
To address these challenges, this proposal will develop scalable statistical methods to reduce computational costs, improve the modeling of genetic ancestry, and increase accuracy and statistical power across several genomic analyses. We will focus on three specific aims. First, we will develop scalable methods to reconstruct large-scale genome-wide genealogical graphs, capturing evolutionary relation-ships and enabling applications such as simulation, phasing, imputation, and data sharing. Second, we will extend this framework to analyze both ancient and modern genomes, using genealogical graphs to define new ancestry descriptors and study human evolutionary history at fine resolution. Finally, we will create Bayesian machine learning approaches to improve the detection of trait- and disease-associated variants, model multiple traits and ancestries, learn biological function from raw genomic data, and enable distributed cross-biobank analyses. We will implement these models as high-quality, freely available open-source software.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Informatik und Informationswissenschaften Software
- Geisteswissenschaften Geschichte und Archäologie Geschichtswissenschaft
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2025-COG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
OX1 2JD Oxford
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.