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Proteome-scale programmable protein perturbation and induced proximity

Projektbeschreibung

Die Regeln für die Proteinkontrolle neu schreiben

Genomeditierungswerkzeuge können DNS und RNS in kurzer Zeit und in großem Umfang verändern. Auch wenn diese Werkezuge Gene mit bestimmten Merkmalen verknüpfen, gibt es derzeit keine vergleichbaren Methoden zur Kontrolle von Proteinen. Dies schränkt die Möglichkeit ein, Proteinveränderungen mit dem Zellverhalten in einen Zusammenhang zu setzen. Das ERC-finanzierte Projekt ProteinPerturbomics möchte ein programmierbares System entwickeln, das viele Proteine gleichzeitig kontrollieren kann. Mittels Genomeditierung und induzierter Proteinnähe kann das Team Proteine markieren oder ihren Abbau in den Zellen bewirken. Das Projekt läuft in drei Schritten ab. Als Erstes werden Proteine im gesamten menschlichen Proteom anvisiert. Als Zweites soll untersucht werden, wie Arzneimittelziele mit proteinabbauenden Faktoren in Wechselwirkung stehen. Als Drittes werden Möglichkeiten zur Umprogrammierung von Krebszellen mittels Veränderung der Wirkungsweise von Schlüsselproteinen erforscht. Das übergeordnete Ziel besteht darin, neue Werkzeuge für die Biologie zu schaffen und die Suche nach potenziellen neuen Krebsbehandlungen zu unterstützen.

Ziel

Programmable perturbation technologies such as CRISPR-Cas have transformed how we study biological systems by offering efficient and scalable methods to manipulate DNA and RNA, thereby linking genotype to phenotype. However, corresponding technologies for rationally manipulating all proteins have lagged behind, restricting our ability to connect proteotypes to phenotypes. Developing a programmable protein perturbation technology would be a breakthrough in the biomedical sciences, as it would facilitate the interrogation of biology and creation of medicines in fundamentally new ways. The overarching goal of this proposal is to develop and apply such a high-throughput programmable protein perturbation platform by combining tools and concepts at the intersection of gene editing, proximity-induced pharmacology, and pooled screening. Our preliminary work has already established a foundation for this, including successful demonstration of high-throughput prime editing–mediated epitope tagging and targeted protein degradation (TPD) as well as induced proximity between any two proteins of interest. In this proposal, we will build upon these advances by: 1) establishing a proteome-scale TPD platform and applying it to uncover the time-resolved human protein essentialome, 2) interrogating the interactions between hundreds of therapeutic target proteins and thousands of protein degradation effectors in order to identify new strategies for induced-proximity therapeutics, and 3) characterizing a therapeutic landscape of cancer cell reprogramming strategies in which the function of cancer-associated proteins are overwritten by an endogenous effector protein. This proposal introduces new technologies for high-throughput programmable protein perturbation and induced proximity, offering insights into essential proteins, strategies for cancer treatment based on induced-proximity pharmacology, and a transformative methodology enabling broad applications in biology and medicine.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2025-COG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 2 000 000,00
Adresse
Raemistrasse 101
8092 Zuerich
Schweiz

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Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 2 000 000,00

Begünstigte (1)

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