Descrizione del progetto
Riscrivere le regole del controllo proteico
Gli strumenti di editing genetico consentono di modificare il DNA e l’RNA con rapidità e su larga scala. Sebbene questi strumenti consentano di collegare i geni a tratti specifici, attualmente non esistono metodi analoghi per il controllo delle proteine. Ciò limita la possibilità di collegare le alterazioni proteiche al comportamento cellulare. Il progetto ProteinPerturbomics, finanziato dal CER, mira a realizzare un sistema programmabile in grado di controllare contemporaneamente numerose proteine. Il team utilizza l’editing genetico e la prossimità indotta delle proteine per marcare le proteine o provocarne la degradazione all’interno delle cellule. Il progetto si articola in tre fasi. In primo luogo, si concentrerà sulle proteine presenti nel proteoma umano. In secondo luogo, studierà come i bersagli farmacologici interagiscono con i fattori che degradano le proteine. In terzo luogo, esplorerà modi per riprogrammare le cellule tumorali modificando il funzionamento di alcune proteine chiave. L’obiettivo generale è quello di creare nuovi strumenti per la biologia e sostenere la ricerca di potenziali nuove terapie contro il cancro.
Obiettivo
Programmable perturbation technologies such as CRISPR-Cas have transformed how we study biological systems by offering efficient and scalable methods to manipulate DNA and RNA, thereby linking genotype to phenotype. However, corresponding technologies for rationally manipulating all proteins have lagged behind, restricting our ability to connect proteotypes to phenotypes. Developing a programmable protein perturbation technology would be a breakthrough in the biomedical sciences, as it would facilitate the interrogation of biology and creation of medicines in fundamentally new ways. The overarching goal of this proposal is to develop and apply such a high-throughput programmable protein perturbation platform by combining tools and concepts at the intersection of gene editing, proximity-induced pharmacology, and pooled screening. Our preliminary work has already established a foundation for this, including successful demonstration of high-throughput prime editing–mediated epitope tagging and targeted protein degradation (TPD) as well as induced proximity between any two proteins of interest. In this proposal, we will build upon these advances by: 1) establishing a proteome-scale TPD platform and applying it to uncover the time-resolved human protein essentialome, 2) interrogating the interactions between hundreds of therapeutic target proteins and thousands of protein degradation effectors in order to identify new strategies for induced-proximity therapeutics, and 3) characterizing a therapeutic landscape of cancer cell reprogramming strategies in which the function of cancer-associated proteins are overwritten by an endogenous effector protein. This proposal introduces new technologies for high-throughput programmable protein perturbation and induced proximity, offering insights into essential proteins, strategies for cancer treatment based on induced-proximity pharmacology, and a transformative methodology enabling broad applications in biology and medicine.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze mediche e della salute medicina di base farmacologia e farmacia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-COG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
8092 Zuerich
Svizzera
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.