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Bayesian phylogenetic models for the evolution of gene expression on single-cell lineages

Projektbeschreibung

Evolution der Genexpression in Krebszellen

Die Entstehung von Krebs ist ein evolutionärer Prozess, bei dem sich in Tumorzellen Veränderungen ansammeln, die das Fortschreiten der Erkrankung und die Resistenz gegenüber Behandlungen begünstigen. Um die Tumoranpassung zu entschlüsseln, ist es unerlässlich zu verstehen, wie sich die Genexpression über einzelner Krebszelllinien hinweg entwickelt und welche Faktoren diese Veränderungen beeinflussen. Dank fortgeschrittener Einzelzelltechnologien ist es nun möglich, diese Dynamiken mit einer bisher unerreichten Auflösung nachzuverfolgen. Es mangelt jedoch an soliden statistischen Rahmenkonzepten zur Interpretation von Daten dieser Art. Mit Unterstützung der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen entwickelt das Team des Projekts PhyloCELL-EXP bayessche phylogenetische Modelle, um Veränderungen der Genexpression entlang von Krebszelllinien zu rekonstruieren und diese mit genetischen und umweltbedingten Faktoren in Verbindung zu bringen. Diese Werkzeuge werden auf reale Multiomik-Datensätze angewendet und setzen damit neue Maßstäbe in der rechnergestützten Erforschung der Tumorentwicklung.

Ziel

The PhyloCELL-EXP project is dedicated to developing and implementing robust statistical models to understand the evolutionary dynamics of gene expression in single-cell cancer lineages. We will leverage advanced Bayesian phylogenetic frameworks such as BEAST2 to systematically identify fast evolving cell lineages, reconstruct gene expression changes along cell phylogenies, and link these changes to both genetic and micro-environmental factors. Our methodological approaches will include algorithms for detecting shifts in evolutionary rates, and Brownian Motion and Ornstein-Uhlenbeck models for gene expression, that are scalable to handle thousands of genes and hundreds of cells. By making use of real multi-omics cancer datasets, PhyloCELL-EXP’s quantitative models will enable genetic inheritance and plasticity in cancer adaptation and progression to be characterized, setting new standards in statistical and computational tumor evolution research.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

UNIVERSIDAD DE VIGO
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 194 074,56
Adresse
LG CAMPUS LAGOAS MARCOSENDE
36310 VIGO PONTEVEDRA
Spanien

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Region
Noroeste Galicia Pontevedra
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0