Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Bayesian phylogenetic models for the evolution of gene expression on single-cell lineages

Opis projektu

Ewolucja ekspresji genów w komórkach raka

Rozwój nowotworu to proces ewolucyjny, w ramach którego komórki raka gromadzą zmiany napędzające postęp choroby i oporność na leczenie. Zrozumienie, w jaki sposób zmienia się ekspresja genów w poszczególnych liniach komórek nowotworowych oraz co powoduje te zmiany, jest niezbędne do wyjaśnienia mechanizmów adaptacji nowotworu. Teraz zaawansowane technologie badania pojedynczych komórek pozwalają śledzić tę dynamikę z niespotykaną dotąd rozdzielczością. Brak jednak solidnych ram statystycznych umożliwiających interpretację takich danych. W ramach realizowanego przy wsparciu programu działań „Maria Skłodowska-Curie” projektu PhyloCELL-EXP opracowywane są bayesowskie modele filogenetyczne służące do rekonstrukcji zmian w ekspresji genów w liniach komórek nowotworowych, łącząc je z czynnikami genetycznymi i środowiskowymi. Narzędzia te zostaną zastosowane do analizy rzeczywistych zbiorów danych multiomicznych, wyznaczając nowe standardy w komputerowych badaniach nad ewolucją nowotworów.

Cel

The PhyloCELL-EXP project is dedicated to developing and implementing robust statistical models to understand the evolutionary dynamics of gene expression in single-cell cancer lineages. We will leverage advanced Bayesian phylogenetic frameworks such as BEAST2 to systematically identify fast evolving cell lineages, reconstruct gene expression changes along cell phylogenies, and link these changes to both genetic and micro-environmental factors. Our methodological approaches will include algorithms for detecting shifts in evolutionary rates, and Brownian Motion and Ornstein-Uhlenbeck models for gene expression, that are scalable to handle thousands of genes and hundreds of cells. By making use of real multi-omics cancer datasets, PhyloCELL-EXP’s quantitative models will enable genetic inheritance and plasticity in cancer adaptation and progression to be characterized, setting new standards in statistical and computational tumor evolution research.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2025-PF

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

UNIVERSIDAD DE VIGO
Wkład UE netto
€ 194 074,56
Koszt całkowity
Brak danych