Skip to main content
Vai all'homepage della Commissione europea (si apre in una nuova finestra)
italiano it
CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
CORDIS

Bayesian phylogenetic models for the evolution of gene expression on single-cell lineages

Descrizione del progetto

L’evoluzione dell’espressione genica nelle cellule tumorali

Lo sviluppo del cancro è un processo evolutivo in cui le cellule tumorali accumulano mutazioni che determinano la progressione della malattia e la resistenza alle terapie. Comprendere come si evolve l’espressione genica nei singoli lignaggi di cellule tumorali e quali fattori determinano tali cambiamenti è fondamentale per decifrare il processo di adattamento del tumore. Le tecnologie avanzate basate sull’analisi delle singole cellule consentono oggi di monitorare queste dinamiche con una risoluzione senza precedenti, ma mancano solidi modelli statistici per interpretare tali dati. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto PhyloCELL-EXP sviluppa modelli filogenetici bayesiani per ricostruire i cambiamenti nell’espressione genica lungo i lignaggi delle cellule tumorali, collegandoli a fattori genetici e ambientali. Questi strumenti saranno applicati a set di dati multiomici reali, stabilendo nuovi standard nella ricerca computazionale sull’evoluzione dei tumori.

Obiettivo

The PhyloCELL-EXP project is dedicated to developing and implementing robust statistical models to understand the evolutionary dynamics of gene expression in single-cell cancer lineages. We will leverage advanced Bayesian phylogenetic frameworks such as BEAST2 to systematically identify fast evolving cell lineages, reconstruct gene expression changes along cell phylogenies, and link these changes to both genetic and micro-environmental factors. Our methodological approaches will include algorithms for detecting shifts in evolutionary rates, and Brownian Motion and Ornstein-Uhlenbeck models for gene expression, that are scalable to handle thousands of genes and hundreds of cells. By making use of real multi-omics cancer datasets, PhyloCELL-EXP’s quantitative models will enable genetic inheritance and plasticity in cancer adaptation and progression to be characterized, setting new standards in statistical and computational tumor evolution research.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

UNIVERSIDAD DE VIGO
Contributo netto dell'UE
€ 194 074,56
Indirizzo
LG CAMPUS LAGOAS MARCOSENDE
36310 VIGO PONTEVEDRA
Spagna
Regione
Noroeste Galicia Pontevedra
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato