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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Haplotype-based inference of hidden structure in the human genome

Ziel

The rapid emergence of high-throughput genomic technologies—such as low-coverage sequencing (LCS), ancient DNA (aDNA), and long-read sequencing (LRS)—offers unprecedented opportunities to explore human evolutionary history and advance medical genetics. However, the full potential of these data remains underexploited due to analytical and methodological limitations: for example, low coverage aDNA (<0.5x) is typically excluded ancestral recombination graph (ARG) analyses, while low structural variant (SV) genotyping accuracy and the lack of reliable imputation panels limit population-scale association studies.

This project proposes the development of two innovative haplotype-based statistical methods to overcome these barriers and unlock novel biological insights. First, I will establish a unified framework that integrates ARG construction with genotype imputation, enabling robust large-scale genealogical and demographic analyses of both modern and ancient low-coverage genomes. Second, I will develop a probabilistic haplotype-based approach for structural variant (SV) genotyping and imputation with long-read sequencing data, applying it to large population cohorts. These methods will be validated on cutting-edge resources, including the UK Biobank and the Allen Ancient DNA Resource, and disseminated through open-source software.

By bridging methodological gaps in aDNA and SV analyses, this project will deliver tools for demography inference using ARGs, SV-informed trait mapping, and the integration of diverse genomic data in population and medical genomics. The first application of the tools will have profound impacts. The unlocked high-resolution human history will contribute to public discourse on the definition and biomedical use of genetic ancestry. Discoveries of disease-associated SVs and underlying biological mechanisms will inform drug development, personalized treatment, and supporting industrial innovation.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 276 187,92
Adresse
WELLINGTON SQUARE UNIVERSITY OFFICES
OX1 2JD Oxford
Vereinigtes Königreich

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Region
South East (England) Berkshire, Buckinghamshire and Oxfordshire Oxfordshire
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0