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Two-field TROSY NMR to reveal interactions of intrinsically disordered proteins and weakly folded states. Application to transcription regulation.

Descripción del proyecto

Estudio de las interacciones dinámicas entre proteínas con nuevos métodos de resonancia magnética nuclear

Las interacciones entre proteínas siguen siendo uno de los grandes interrogantes de la biología molecular y dificultan la comprensión de numerosos procesos celulares esenciales. En el proyecto 2FNMR4MInDer, que cuenta con el respaldo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, se desarrollará una metodología de resonancia magnética nuclear (RMN) para estudiar interacciones dinámicas entre proteínas, especialmente aquellas en las que intervienen regiones intrínsecamente desordenadas. El nuevo método combinará mediciones en dos campos magnéticos y aprovechará las propiedades complementarias de las señales del flúor-19 y del carbono-13, lo que mejorará la resolución y la sensibilidad en sistemas difíciles de observar debido al ensanchamiento de la señal. El objetivo del proyecto es comprender mejor la función de las proteínas parcialmente desordenadas en procesos biológicos fundamentales, como la transcripción, y avanzar en el desarrollo de las técnicas de RMN.

Objetivo

Interactions of biomolecules are essential for all molecular processes of life. Biomolecules interact dynamically, constantly changing their conformational ensembles to adapt to stimuli and carry out their functions. Protein interactions often involve intrinsically disordered regions (IDRs), which are challenging targets for traditional methods like X-ray crystallography and cryo-electron microscopy). Nuclear Magnetic Resonance (NMR) excels at capturing molecular dynamics experimentally and characterizing IDRs with atomic-resolution. However, interacting IDRs suffer from signal broadening from conformational exchange, particularly when the interface retains a degree of disorder, often preventing NMR analysis. We need new methods to investigate these interactions. To address this, we introduce two-field TROSY NMR, a new methodology that leverages a world-unique prototype NMR spectrometer with two magnetic centers. This approach combines the favorable characteristics of two nuclei fluorine-19 and carbon-13 at two fields (1.88 and 14.1 T): narrower and more intense signals at low field for fluorine-19, combined with signal detection at high field for optimal relaxation of carbon-13 nuclei (less sensitive to chemical exchange broadening), ensuring high resolution and sensitivity. This new ability to observe 13C19F pairs on aromatic side chains will allow us to determine conformational properties of weakly folded states and reveal subtle conformational changes in IDPs, crucial for understanding biological processes like transcription. We will apply this method to investigate the interactions between the hub RST domain from Radical-Induced Cell Death1 and three transcription factors partners, which explore the conformational disorder-order continuum. This project will be a breakthrough for NMR methodology and instrumentation, opening a new era for the investigation of weakly folded systems and provide fundamental new insights on the molecular processes of transcription.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Coordinador

ECOLE NORMALE SUPERIEURE
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 226 420,56
Dirección
45, RUE D'ULM
75230 Paris
Francia

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Región
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos

Socios (1)