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Two-field TROSY NMR to reveal interactions of intrinsically disordered proteins and weakly folded states. Application to transcription regulation.

Descrizione del progetto

Studio delle interazioni proteiche flessibili con nuovi metodi di risonanza magnetica nucleare

Comprendere come interagiscono le proteine rimane una sfida importante nella biologia molecolare, rendendo difficile spiegare molti processi cellulari essenziali. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto 2FNMR4MInDer sta sviluppando una metodologia basata sulla risonanza magnetica nucleare (RMN) per superare gli attuali limiti nello studio delle interazioni proteiche dinamiche e debolmente strutturate, in particolare quelle che coinvolgono regioni intrinsecamente disordinate. Il progetto combina misurazioni effettuate a due diversi campi magnetici e sfrutta le proprietà complementari dei segnali del fluoro-19 e del carbonio-13, migliorando la risoluzione e la sensibilità per sistemi che sono normalmente difficili da osservare a causa dell’allargamento del segnale. L’obiettivo del progetto è comprendere meglio come funzionano le proteine parzialmente disordinate in processi biologici chiave quali la trascrizione, promuovendo al contempo lo sviluppo della tecnologia RMN in senso più ampio.

Obiettivo

Interactions of biomolecules are essential for all molecular processes of life. Biomolecules interact dynamically, constantly changing their conformational ensembles to adapt to stimuli and carry out their functions. Protein interactions often involve intrinsically disordered regions (IDRs), which are challenging targets for traditional methods like X-ray crystallography and cryo-electron microscopy). Nuclear Magnetic Resonance (NMR) excels at capturing molecular dynamics experimentally and characterizing IDRs with atomic-resolution. However, interacting IDRs suffer from signal broadening from conformational exchange, particularly when the interface retains a degree of disorder, often preventing NMR analysis. We need new methods to investigate these interactions. To address this, we introduce two-field TROSY NMR, a new methodology that leverages a world-unique prototype NMR spectrometer with two magnetic centers. This approach combines the favorable characteristics of two nuclei fluorine-19 and carbon-13 at two fields (1.88 and 14.1 T): narrower and more intense signals at low field for fluorine-19, combined with signal detection at high field for optimal relaxation of carbon-13 nuclei (less sensitive to chemical exchange broadening), ensuring high resolution and sensitivity. This new ability to observe 13C19F pairs on aromatic side chains will allow us to determine conformational properties of weakly folded states and reveal subtle conformational changes in IDPs, crucial for understanding biological processes like transcription. We will apply this method to investigate the interactions between the hub RST domain from Radical-Induced Cell Death1 and three transcription factors partners, which explore the conformational disorder-order continuum. This project will be a breakthrough for NMR methodology and instrumentation, opening a new era for the investigation of weakly folded systems and provide fundamental new insights on the molecular processes of transcription.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Coordinatore

ECOLE NORMALE SUPERIEURE
Contributo netto dell'UE
€ 226 420,56
Indirizzo
45, RUE D'ULM
75230 Paris
Francia
Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato

Partner (1)