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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-06-18

OncoTrack - Methods for systematic next generation oncology biomarker development

Ziel

We propose here an exhaustive analysis of the genome, exome, methylome and transcriptome of primary tumours and metastases from patients with colon carcinoma, based on a combination of deep sequencing and chip based techniques. Dependent on their availability, we shall also perform analyses of tumor stem cells, circulating tumor cells, free tumor DNA in serum and xenografts derived from the same patients. This will be complemented by the development and application of highly sensitive techniques to identify individual mutations, transcripts and proteins/protein complexes both in-situ in pathology slides as well as in patients’ blood or serum. The integration of these results will allow us to address the heterogeneity of the tumor samples, to deduce the genome/epigenome/transcriptome of the different cell types making up or originating from the tumor (e.g. circulating tumor cells, tumour stem cells or xenografts), to establish models able to predict suitable candidates for further biomarker development, and also to predict the effects and side effects of drugs in the treatment of genetically defined groups of patients. Available biomarkers, as well as biomarkers predicted from the work within the project will be validated in patient derived xenograft models and stem cell cultures, and ultimately transferred into a point of care (POC) diagnostic format. In parallel we will explore the use of the global genome and methylome information, e.g. derived from the analysis of free tumor DNA in the serum of the patient, as the ‘ultimate’ biomarker, to model the biology of the tumor (possibly even before any tumor has been localised), and as an independent route to predict clinically relevant parameters. Though sequencing/methylation analysis of the genome of the tumor through free DNA is currently still too costly for use as a routine diagnostic, this is likely to change over the period covered by the grant, due to the extremely rapid progress in the development of large scale sequencing techniques.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

IMI-JU-02-2009
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

JTI-CP-IMI - Joint Technology Initiatives - Collaborative Project (IMI)

Koordinator

Bayer Pharma AG
EU-Beitrag
Keine Daten
Adresse
Muellerstrasse 178
13353 Berlin
Deutschland

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Region
Berlin Berlin Berlin
Aktivitätstyp
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Beteiligte (21)

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