Obiettivo
We propose here an exhaustive analysis of the genome, exome, methylome and transcriptome of primary tumours and metastases from patients with colon carcinoma, based on a combination of deep sequencing and chip based techniques. Dependent on their availability, we shall also perform analyses of tumor stem cells, circulating tumor cells, free tumor DNA in serum and xenografts derived from the same patients. This will be complemented by the development and application of highly sensitive techniques to identify individual mutations, transcripts and proteins/protein complexes both in-situ in pathology slides as well as in patients’ blood or serum. The integration of these results will allow us to address the heterogeneity of the tumor samples, to deduce the genome/epigenome/transcriptome of the different cell types making up or originating from the tumor (e.g. circulating tumor cells, tumour stem cells or xenografts), to establish models able to predict suitable candidates for further biomarker development, and also to predict the effects and side effects of drugs in the treatment of genetically defined groups of patients. Available biomarkers, as well as biomarkers predicted from the work within the project will be validated in patient derived xenograft models and stem cell cultures, and ultimately transferred into a point of care (POC) diagnostic format. In parallel we will explore the use of the global genome and methylome information, e.g. derived from the analysis of free tumor DNA in the serum of the patient, as the ‘ultimate’ biomarker, to model the biology of the tumor (possibly even before any tumor has been localised), and as an independent route to predict clinically relevant parameters. Though sequencing/methylation analysis of the genome of the tumor through free DNA is currently still too costly for use as a routine diagnostic, this is likely to change over the period covered by the grant, due to the extremely rapid progress in the development of large scale sequencing techniques.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze mediche e della salute biotecnologia medica tecnologie cellulari cellule staminali
- scienze mediche e della salute medicina di base patologia
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
IMI-JU-02-2009
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
JTI-CP-IMI - Joint Technology Initiatives - Collaborative Project (IMI)
Coordinatore
13353 Berlin
Germania
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I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.
Partecipanti (21)
80539 MUNCHEN
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751 05 Uppsala
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WC1E 6BT LONDON
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69006 Lyon
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12489 Berlin
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91405 ORSAY CEDEX
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13125 Berlin
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10117 Berlin
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8010 GRAZ
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01069 DRESDEN
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Partecipazione conclusa
80333 Muenchen
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151 85 Sodertaelje
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55218 Ingelheim
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2340 Beerse
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64293 Darmstadt
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CT13 9NJ Sandwich
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4070 Basel
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RG21 4FA BASINGSTOKE
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10691 Stockholm
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08035 Barcelona
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14195 Berlin
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