Obiettivo
Using nanoflow LC coupled on-line to a novel FTICR mass spectrometer we want to describe the complexity of histone modifications and define co-occurring modifications. We want to then investigate the biological role of these simultaneous present modifications by using synthetic peptides for pull-down experiments and stable isotope labelling for quantitation and effective background subtraction to identify specifically binding proteins. We will focus after the implementation and test of the methods in a global scenario on metH3K9 which is central for gene silencing. In this way we intend to find out if other modifications are involved in fine-tuning and regulating gene silencing. This is central for our understanding of the histone code and epigenetics and may lead to a better understanding of cancer.
M. Salek will move for this project to J. Rappsilber's group in Milan. He brings with him the experience of a PhD in mass spectrometric analysis of protein modifications and method development. He will be trained in LC-MS and FTICR MS and expand his experimental repertoire by peptide synthesis and pull down experiments. He will expand his analytical training into medical direction joining a campus that hosts two large cancer research institutes and is affiliated with two major cancer hospitals in Milan. The increased expertise in technology, in medical applications, and in administration will put him after this fellowship in an excellent position to respond to the European urge for proteomics groups.
J. Rappsilber's group will gain with M. Salek competence essential for the proposed project and for the success of the group. M. Salek's connection to his former lab will result in transfer of expertise in the analysis of protein modification and long term access to instrumentation available there. M. Salek will go for a short stay to M. Mann's lab, one of the leading proteomics centres worldwide, and allow tightening the link to this lab while getting himself networked.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
- scienze naturali scienze chimiche chimica analitica spettrometria di massa
- scienze naturali scienze biologiche genetica epigenetica
- scienze naturali scienze biologiche biologia molecolare
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP6-2002-MOBILITY-5
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
MILAN
Italia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.