Objectif The GEN2PHEN project aims to unify human and model organism genetic variation databases towards increasingly holistic views into Genotype-To-Phenotype (G2P) data, and to link this system into other biomedical knowledge sources via genome browser functionality. The project will establish the technological building-blocks needed for the evolution of today’s diverse G2P databases into a future seamless G2P biomedical knowledge environment. The project will then utilise these elements to construct an operational first-version of that knowledge environment, by the projects end. This will consist of a European-centred but globally-networked hierarchy of bioinformatics GRID-linked databases, tools and standards, all tied into the Ensembl genome browser. The project has the following specific objectives: 1) To analyse the G2P field and thus determine emerging needs and practices; 2) To develop key standards for the G2P database field; 3) To create generic database components, services, and integration infrastructures for the G2P database domain; 4) To create search modalities and data presentation solutions for G2P knowledge; 5) To facilitate the process of populating G2P databases; 6) To build a major G2P internet portal; 7) To deploy GEN2PHEN solutions to the community; 8) To address system durability and long-term financing; 9) To undertake a whole-system utility and validation pilot study GEN2PHEN Consortium members have been selected from a talented pool of European research groups and companies that are interested in the G2P database challenge. Additionally, a few non-EU participants have been included to bring extra capabilities to the initiative. The final constellation is characterised by broad and proven competence, a network of established working relationships, and high-level roles/connections within other significant projects in this domain. Champ scientifique natural sciencescomputer and information sciencesinternetnatural sciencescomputer and information sciencesdatabasesnatural sciencesbiological sciencesgeneticsgenomes Mots‑clés GRID Genetic variation association studies bioinformatics biomedical knowledge clinical diagnostics database database integration disease genetics genome browser genotype to phenotype model organisms Programme(s) FP7-HEALTH - Specific Programme "Cooperation": Health Thème(s) HEALTH-2007-1.1-1 - Unifying human and model organism genetic variation databases Appel à propositions FP7-HEALTH-2007-A Voir d’autres projets de cet appel Régime de financement CP-IP - Large-scale integrating project Coordinateur UNIVERSITY OF LEICESTER Contribution de l’UE € 2 685 819,72 Adresse UNIVERSITY ROAD LE1 7RH Leicester Royaume-Uni Voir sur la carte Région East Midlands (England) Leicestershire, Rutland and Northamptonshire Leicester Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Marie Adams (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée Participants (22) Trier par ordre alphabétique Trier par contribution de l’UE Tout développer Tout réduire EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY Allemagne Contribution de l’UE € 1 889 510,00 Adresse Meyerhofstrasse 1 69117 Heidelberg Voir sur la carte Région Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis Type d’activité Research Organisations Contact administratif Keith Williamson (Mr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée FUNDACIO INSTITUT HOSPITAL DEL MAR D INVESTIGACIONS MEDIQUES Participation terminée Espagne Contribution de l’UE € 722 682,09 Adresse Doctor Aiguader 88 08003 Barcelona Voir sur la carte Région Este Cataluña Barcelona Type d’activité Research Organisations Contact administratif Nathalie Villahoz (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée ACADEMISCH ZIEKENHUIS LEIDEN Pays-Bas Contribution de l’UE € 1 158 437,00 Adresse ALBINUSDREEF 2 2333 ZA Leiden Voir sur la carte Région West-Nederland Zuid-Holland Agglomeratie Leiden en Bollenstreek Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Linda Ouwerkerk (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE France Contribution de l’UE € 855 897,39 Adresse RUE DE TOLBIAC 101 75654 Paris Voir sur la carte Région Ile-de-France Ile-de-France Paris Type d’activité Research Organisations Contact administratif Ghislaine Gibello (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée KAROLINSKA INSTITUTET Suède Contribution de l’UE € 169 080,00 Adresse Nobels Vag 5 17177 Stockholm Voir sur la carte Région Östra Sverige Stockholm Stockholms län Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Ingrid Grahn (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée IDRYMA TECHNOLOGIAS KAI EREVNAS Grèce Contribution de l’UE € 215 011,00 Adresse N PLASTIRA STR 100 70013 Irakleio Voir sur la carte Région Νησιά Αιγαίου Κρήτη Ηράκλειο Type d’activité Research Organisations Contact administratif Zinovia Papatheodorou (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée COMMISSARIAT A L ENERGIE ATOMIQUE ET AUX ENERGIES ALTERNATIVES France Contribution de l’UE € 190 523,00 Adresse RUE LEBLANC 25 75015 PARIS 15 Voir sur la carte Région Ile-de-France Ile-de-France Paris Type d’activité Research Organisations Contact administratif Elizabeth May (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée ERASMUS UNIVERSITAIR MEDISCH CENTRUM ROTTERDAM Participation terminée Pays-Bas Contribution de l’UE € 258 088,59 Adresse DR MOLEWATERPLEIN 40 3015 GD Rotterdam Voir sur la carte Région West-Nederland Zuid-Holland Groot-Rijnmond Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Maria A.J. Van Zeijl (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée HELSINGIN YLIOPISTO Finlande Contribution de l’UE € 824 799,00 Adresse YLIOPISTONKATU 3 00014 Helsingin Yliopisto Voir sur la carte Région Manner-Suomi Helsinki-Uusimaa Helsinki-Uusimaa Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Tiina Berg (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée UNIVERSIDADE DE AVEIRO Portugal Contribution de l’UE € 346 766,00 Adresse CAMPUS UNIVERSITÁRIO DE SANTIAGO 3810-193 Aveiro Voir sur la carte Région Continente Centro (PT) Região de Aveiro Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Francisco Vaz (Prof.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée UNIVERSITY OF THE WESTERN CAPE Participation terminée Afrique du Sud Contribution de l’UE € 60 435,28 Adresse ROBERT SOBUKWE ROAD 7535 Cape Town Voir sur la carte Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Heikki Lehvaslaiho (Prof.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée COUNCIL OF SCIENTIFIC AND INDUSTRIAL RESEARCH Inde Contribution de l’UE € 229 521,00 Adresse Anusandhan Bhawan, Rafi Marg 2 110001 New Dehli Voir sur la carte Type d’activité Research Organisations Contact administratif T.V. Joshua (Mr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée SIB SWISS INSTITUTE OF BIOINFORMATICS Suisse Contribution de l’UE € 257 138,00 Adresse RUE MICHEL SERVET 1 CMU 1206 Geneve Voir sur la carte Région Schweiz/Suisse/Svizzera Région lémanique Genève Type d’activité Research Organisations Contact administratif Nicole Cornuz (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée THE UNIVERSITY OF MANCHESTER Royaume-Uni Contribution de l’UE € 701 614,00 Adresse OXFORD ROAD M13 9PL Manchester Voir sur la carte Région North West (England) Greater Manchester Manchester Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Liz Fay (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée BIOBASE GMBH Allemagne Contribution de l’UE € 153 285,00 Adresse Halchtersche Strasse 33 38304 WOLFENBUETTEL Voir sur la carte Type d’activité Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Contact administratif Michael Tysiak (Mr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée ISLENSK ERFDAGREINING EHF Islande Contribution de l’UE € 37 230,61 Adresse STURLUGOTU 8 101 Reykjavik Voir sur la carte Région Ísland Ísland Höfuðborgarsvæði Type d’activité Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Contact administratif Gudmundur Einarsson (Mr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée PHENOSYSTEMS SA Belgique Contribution de l’UE € 141 279,00 Adresse Rue Raymond Lebleux, 114 Batiment H3 1428 LILLOIS WITTERZEE Voir sur la carte Type d’activité Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Contact administratif David Atlan (Dr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée BIOCOMPUTING PLATFORMS LTD OY Finlande Contribution de l’UE € 184 901,00 Adresse INNOPOLI 3 VAISALANTIE 6 02130 Espoo Voir sur la carte Région Manner-Suomi Helsinki-Uusimaa Helsinki-Uusimaa Type d’activité Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Contact administratif Heidi Anita Eliasson (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée PANEPISTIMIO PATRON Grèce Contribution de l’UE € 360 859,41 Adresse UNIVERSITY CAMPUS RIO PATRAS 265 04 Rio Patras Voir sur la carte Région Κεντρική Ελλάδα Δυτική Ελλάδα Αχαΐα Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Vassilis Tsagaris Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée SYNAPSE RESEARCH MANAGEMENT PARTNERS SL Espagne Contribution de l’UE € 346 489,91 Adresse CALLE VELAZQUEZ 94 PLANTA 1 28006 Madrid Voir sur la carte Région Comunidad de Madrid Comunidad de Madrid Madrid Type d’activité Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Contact administratif Eva Molero (Mr.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée MAX IV Laboratory, Lund University Suède Contribution de l’UE € 50 000,00 Adresse Paradisgatan 5c 22100 LUND Voir sur la carte Région Södra Sverige Sydsverige Skåne län Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Mauno Vihinen (Prof.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée ACADEMISCH ZIEKENHUIS GRONINGEN Pays-Bas Contribution de l’UE € 50 000,00 Adresse HANZEPLEIN 1 9713 GZ Groningen Voir sur la carte Région Noord-Nederland Groningen Overig Groningen Type d’activité Higher or Secondary Education Establishments Contact administratif Johanna M Van Apeldoorn (Ms.) Liens Contacter l’organisation Opens in new window Site web Opens in new window Coût total Aucune donnée
