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Contenuto archiviato il 2024-06-18

A combined experimental and computational approach for quantitative and mechanistic understanding of transcriptional regulation

Obiettivo

The complex functions of a living cell are carried out through the coordinated activity of many genes. Since transcription is a key step in establishing such coordinated activity, much effort was devoted to its study, and tremendous progress was made in identifying many of the transcription factors and regulatory DNA elements involved in the regulation of specific systems. However, very few attempts were made at going beyond these phenomenological and qualitative descriptions. Consequently, we are far from a quantitative and predictive understanding of transcriptional regulation. Through this program, I aim to develop a mechanistic understanding of transcriptional regulation, and for the first time model the entire process. We wish to go much beyond identifying and qualitatively describing the involved components, and arrive at a quantitative understanding of how transcriptional programs are encoded in the DNA sequences. To this end, my team and I will first work to mechanistically understand various building blocks of the transcriptional system, including: mechanisms of activation and repression; binding cooperativity; binding competition; transcription factors and chromatin interplay; architectural features of promoters that are important for its function; and the transcription functions “computed” by promoters. Since existing data are clearly insufficient for addressing such questions, I have opened an experimental lab and began to assemble a multidisciplinary team of scientists whose expertise span the experimental biology, computer science, physics, statistics, and mathematics disciplines, that will work synergistically to generate the appropriate data, analyze it, and use it to construct and experimentally validate models for the above transcriptional building blocks. We will then integrate all the insights gained into unified and quantitative models that should significantly enhance our understanding of the mechanistic workings of transcriptional regulation.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

ERC-2007-StG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Istituzione ospitante

WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE
Contributo UE
€ 1 005 600,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

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