Objetivo
Alternative pre-mRNA splicing plays a central role in generating the complex proteome of metazoans. About 60% of human genes are alternatively spliced and a compromise in this process is known to cause multiple human diseases. An understanding of the mecha nisms that regulate alternative splicing will be essential for a functional interpretation of the genome. We propose to study the co-transcriptional recruitment of splicing regulatory proteins-specifically SR proteins- onto the pre-mRNA. Such an analysis w ould be valuable since the coupling of splicing to transcription has been shown to contribute to alternative splicing regulation. My approach will involve analysis of RNA while it is still attached to the chromosomal DNA, during the act of transcription by RNA polymeraseII. Recruitment of the basic splicing machinery to target genes by this novel method has been shown in the host lab. I propose to examine the detectability and distribution of SR proteins on a candidate gene that undergoes alternative splici ng to encode either calcitonin or the neuropeptide CGRP. Through chromosomal immunoprecipitation (CHIP) I will determine the sites along the gene at which the SR proteins are recruited. Since the splicing of this gene can be manipulated in cell culture, I will be able to determine the consequential changes in SR protein recruitment. This will be followed by analysis of changes in recruitment pattern when critical sequences in the gene are altered. In a complementary approach we will alter the levels of the SR protein and analyse its affect on alternative splicing regulation. Lastly, I will extend the analysis to a global scale by carrying out CHIP followed by hybridization to DNA microarrays, designed to detect genomic intron and exon regions. This study wil l identify the yet unknown endogenouos gene targets for the SR proteins. Thus, I will be able to build a comprehensive picture of splicing factor recruitment and its regulation of alternative splicing.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP6-2004-MOBILITY-7
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
IIF - Marie Curie actions-Incoming International Fellowships
Coordinador
DRESDEN
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.