Ziel
Alternative pre-mRNA splicing plays a central role in generating the complex proteome of metazoans. About 60% of human genes are alternatively spliced and a compromise in this process is known to cause multiple human diseases. An understanding of the mecha nisms that regulate alternative splicing will be essential for a functional interpretation of the genome. We propose to study the co-transcriptional recruitment of splicing regulatory proteins-specifically SR proteins- onto the pre-mRNA. Such an analysis w ould be valuable since the coupling of splicing to transcription has been shown to contribute to alternative splicing regulation. My approach will involve analysis of RNA while it is still attached to the chromosomal DNA, during the act of transcription by RNA polymeraseII. Recruitment of the basic splicing machinery to target genes by this novel method has been shown in the host lab. I propose to examine the detectability and distribution of SR proteins on a candidate gene that undergoes alternative splici ng to encode either calcitonin or the neuropeptide CGRP. Through chromosomal immunoprecipitation (CHIP) I will determine the sites along the gene at which the SR proteins are recruited. Since the splicing of this gene can be manipulated in cell culture, I will be able to determine the consequential changes in SR protein recruitment. This will be followed by analysis of changes in recruitment pattern when critical sequences in the gene are altered. In a complementary approach we will alter the levels of the SR protein and analyse its affect on alternative splicing regulation. Lastly, I will extend the analysis to a global scale by carrying out CHIP followed by hybridization to DNA microarrays, designed to detect genomic intron and exon regions. This study wil l identify the yet unknown endogenouos gene targets for the SR proteins. Thus, I will be able to build a comprehensive picture of splicing factor recruitment and its regulation of alternative splicing.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine Proteomik
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen
Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
FP6-2004-MOBILITY-7
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
IIF - Marie Curie actions-Incoming International Fellowships
Koordinator
DRESDEN
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.