Obiettivo
Alternative pre-mRNA splicing plays a central role in generating the complex proteome of metazoans. About 60% of human genes are alternatively spliced and a compromise in this process is known to cause multiple human diseases. An understanding of the mecha nisms that regulate alternative splicing will be essential for a functional interpretation of the genome. We propose to study the co-transcriptional recruitment of splicing regulatory proteins-specifically SR proteins- onto the pre-mRNA. Such an analysis w ould be valuable since the coupling of splicing to transcription has been shown to contribute to alternative splicing regulation. My approach will involve analysis of RNA while it is still attached to the chromosomal DNA, during the act of transcription by RNA polymeraseII. Recruitment of the basic splicing machinery to target genes by this novel method has been shown in the host lab. I propose to examine the detectability and distribution of SR proteins on a candidate gene that undergoes alternative splici ng to encode either calcitonin or the neuropeptide CGRP. Through chromosomal immunoprecipitation (CHIP) I will determine the sites along the gene at which the SR proteins are recruited. Since the splicing of this gene can be manipulated in cell culture, I will be able to determine the consequential changes in SR protein recruitment. This will be followed by analysis of changes in recruitment pattern when critical sequences in the gene are altered. In a complementary approach we will alter the levels of the SR protein and analyse its affect on alternative splicing regulation. Lastly, I will extend the analysis to a global scale by carrying out CHIP followed by hybridization to DNA microarrays, designed to detect genomic intron and exon regions. This study wil l identify the yet unknown endogenouos gene targets for the SR proteins. Thus, I will be able to build a comprehensive picture of splicing factor recruitment and its regulation of alternative splicing.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP6-2004-MOBILITY-7
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
IIF - Marie Curie actions-Incoming International Fellowships
Coordinatore
DRESDEN
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.