Objectif
Our knowledge on the marine nitrogen cycle has undergone some major revisions very recently with the discovery of novel pathways mediated by thus far unknown and partly unculturable prokaryotes. Among these new drivers of the nitrogen cycle are non-thermophilic Crenarchaea and Euryarchaea. Recently, Crenarchaea have been shown to harbor the amoA gene, responsible for the expression of ammonia monooxygenase, which represents a key enzyme in the nitrification step. The project aims at determining the dynamics in abundance and activity of these Archaea in European coastal seas. Specific emphasis is paid to differentiate between the free-living, planktonic Archaea and those attached to the two major types of suspended particles in coastal areas, lithogenic vs biogenic particles. We will assess the phylogenetic composition of the free-living and particle-attached crenarchaeal and euryarchaeal communities and compare them with those of beta- and gammaproteobacterial communities as these two bacterial groups are also known to harbor nitrifying phylotypes. Conventional fingerprinting techniques using the 16 S rRNA gene and terminal-restriction fragment length polymorphism, cloning and sequencing will be combined with the pyro-sequencing approach, the latter allowing an unsurpassed resolution of the total number of phylotypes present. Quantitative PCR on the 16S rRNA level and on crenarchaeal and beta- and gammaproteobacterial amoA gene level will be used to determine the number of crenarchaea and bacteria putatively oxidizing ammonia. This approach will be combined with fluorescence in situ hybridization and autoradiography to allow insights into the microspatial distribution of Crenarchaea on suspended particles. These molecular approaches to determine the abundance and phylogeny of nitrifiers in ambient water and on suspended particles are complemented by nitrification rate measurements differentiating, for the first time, bacterial from crenarchaeal nitrification using
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques morphologie biologique morphologie comparative
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
1010 WIEN
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.