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Contenuto archiviato il 2024-05-27

Archaeal activity dynamics in marine snow vs. ambient water in coastal European Sea

Obiettivo

Our knowledge on the marine nitrogen cycle has undergone some major revisions very recently with the discovery of novel pathways mediated by thus far unknown and partly unculturable prokaryotes. Among these new drivers of the nitrogen cycle are non-thermophilic Crenarchaea and Euryarchaea. Recently, Crenarchaea have been shown to harbor the amoA gene, responsible for the expression of ammonia monooxygenase, which represents a key enzyme in the nitrification step. The project aims at determining the dynamics in abundance and activity of these Archaea in European coastal seas. Specific emphasis is paid to differentiate between the free-living, planktonic Archaea and those attached to the two major types of suspended particles in coastal areas, lithogenic vs biogenic particles. We will assess the phylogenetic composition of the free-living and particle-attached crenarchaeal and euryarchaeal communities and compare them with those of beta- and gammaproteobacterial communities as these two bacterial groups are also known to harbor nitrifying phylotypes. Conventional fingerprinting techniques using the 16 S rRNA gene and terminal-restriction fragment length polymorphism, cloning and sequencing will be combined with the pyro-sequencing approach, the latter allowing an unsurpassed resolution of the total number of phylotypes present. Quantitative PCR on the 16S rRNA level and on crenarchaeal and beta- and gammaproteobacterial amoA gene level will be used to determine the number of crenarchaea and bacteria putatively oxidizing ammonia. This approach will be combined with fluorescence in situ hybridization and autoradiography to allow insights into the microspatial distribution of Crenarchaea on suspended particles. These molecular approaches to determine the abundance and phylogeny of nitrifiers in ambient water and on suspended particles are complemented by nitrification rate measurements differentiating, for the first time, bacterial from crenarchaeal nitrification using

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinatore

UNIVERSITAT WIEN
Contributo UE
€ 157 733,20
Indirizzo
UNIVERSITATSRING 1
1010 WIEN
Austria

Mostra sulla mappa

Regione
Ostösterreich Wien Wien
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (1)

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