Obiettivo
The ultimate goal of systems biology is to generate mathematical models to comprehensively describe the dynamics of a biological system. Among all biochemical and informational systems that operate in cells, metabolism is unique because the composition and topology of the network of metabolic reactions is almost completely known. What is currently poorly understood, is how this system operates, how it is controlled and how it adapts to changing conditions of supply and demand. Most current models of metabolism and of biological processes in general are limited by the incompleteness and the restricted diversity of the data they are based on. In this project I propose to generate, for the first time, quantitative data sets of all metabolic proteins and their regulatory phosphorylation sites in the model organism yeast Saccharomyces cerevisiae, under a defined set of conditions. Such a comprehensive proteomic analysis will be achieved by means of a novel targeted proteomics approach, pioneered in the host group and which I preliminarily developed in the first months of my work. In the context of a well-established collaboration with metabolomics and computational systems biology groups at ETH Zurich, the generated proteomic and phosphoproteomics data on metabolic enzymes will be coupled to quantitative data of the associated mRNA transcripts, metabolites and metabolic fluxes. Integration of these different quantitative data types will be done with a genome-scale mathematical model of the whole yeast metabolism. The data generated will be unprecedented and the research will set us on a path towards the understanding of the control structure of S. cerevisiae metabolism and the identification of key regulation sites that actively control metabolic processes, advancing both the science of systems biology as well as our understanding of a universal biological system.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali matematica matematica pura topologia
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine enzimi
- scienze naturali matematica matematica applicata modello matematico
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
8092 Zuerich
Svizzera
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.