Ziel
Higher order chromosomal organisation is an important determinant of gene regulation. Cis-regulatory elements, such as enhancers, Locus Control Regions and insulators that are spread over the DNA can be brought into close proximity. Three new applications have recently been developed to study this organisation: Chromatin Conformation Capture (3C), RNA-TRAP and the UAS-Gal4 method. Imprinted genes are expressed solely from either the maternally or paternally inherited alleles and many are clustered in the ge nome. These genes are marked epigenetically by DNA methylation and histon modifications. The imprinted H19-Igf2 cluster has been studied extensively. The paternally expressed gene insulin-like growth-factor 2 (Igf2) is separated by approximately 100 kb fro m the maternally expressed non-coding gene H19 on mouse distal chromosome 7. Recently it was shown that distally located regions in this cluster have paternal-specific interactions. Here, I propose to study the higher order organisation of the imprinted H19 -Igf2 locus, using a combination of the three new techniques.
In the first place I am interested in regulatory elements that are in brought in proximity of the H19 DMR, and particularly of interest are differences in secondary structure between the paterna l and maternal inherited alleles. The contribution of single elements can be studies with various mice mutants established in the lab of W. Reik. Secondly I will study interactions of various enhancers downstream of Igf2 and the paternal copy of the gene in various tissues. This study will also reveal the placental specific enhancer sequences. In addition to determining DNA sequences involved in the higher order chromatin organisation of the H19-Igf2 locus, I would like to study proteins that are involved. This study will have an important contribution to our understanding of regulation of gene expression by higher order chromosomal organisation.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Chromosom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP6-2004-MOBILITY-5
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
CAMBRIDGE
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.