Obiettivo
Higher order chromosomal organisation is an important determinant of gene regulation. Cis-regulatory elements, such as enhancers, Locus Control Regions and insulators that are spread over the DNA can be brought into close proximity. Three new applications have recently been developed to study this organisation: Chromatin Conformation Capture (3C), RNA-TRAP and the UAS-Gal4 method. Imprinted genes are expressed solely from either the maternally or paternally inherited alleles and many are clustered in the ge nome. These genes are marked epigenetically by DNA methylation and histon modifications. The imprinted H19-Igf2 cluster has been studied extensively. The paternally expressed gene insulin-like growth-factor 2 (Igf2) is separated by approximately 100 kb fro m the maternally expressed non-coding gene H19 on mouse distal chromosome 7. Recently it was shown that distally located regions in this cluster have paternal-specific interactions. Here, I propose to study the higher order organisation of the imprinted H19 -Igf2 locus, using a combination of the three new techniques.
In the first place I am interested in regulatory elements that are in brought in proximity of the H19 DMR, and particularly of interest are differences in secondary structure between the paterna l and maternal inherited alleles. The contribution of single elements can be studies with various mice mutants established in the lab of W. Reik. Secondly I will study interactions of various enhancers downstream of Igf2 and the paternal copy of the gene in various tissues. This study will also reveal the placental specific enhancer sequences. In addition to determining DNA sequences involved in the higher order chromatin organisation of the H19-Igf2 locus, I would like to study proteins that are involved. This study will have an important contribution to our understanding of regulation of gene expression by higher order chromosomal organisation.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica cromosomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP6-2004-MOBILITY-5
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
CAMBRIDGE
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.