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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

Direct Investigation of a Folding Energy Landscape and Its Implications for the Unexplained Folding Behaviour of Spectrin Domains

Objectif

Spectrin domains R15, R16 and R17 are found in tandem arrays in proteins of the cytoskeleton, and spectrin itself is believed to be responsible for maintaining the shape of erythrocites by imparting elasticity to the cell membrane. These three domains share virtually identical structure, stability, contact order, helical propensity, and transition state structure. However, in spite of the striking structural resemblance and the apparently common function, these proteins fold to their native conformation with a speed that varies over more than three orders of magnitude. Why? There is some evidence to suggest that such diversity originates from energy landscape “roughness”. Slow folding domains (R16 and R17) appear to have rough energy landscapes, whereas the fast folding domain R15 has a smooth energy landscape. By means of a novel, single-molecule spectroscopic technique developed by Prof. Benjamin Schuler at the Department of Biochemistry of the University of Zurich, I want to test this hypothesis, investigating directly the energy landscape of these homologous spectrin domains, quantifying the roughness of their energy landscape, and discover its sequence determinants. This research is the first direct investigation of energy landscape roughness of proteins for which this feature is believed to clearly affect the folding rate. These studies could not only result in substantial conceptual progress in the field of protein folding, providing a missing link between theory and experiment, but also lead to further developments of the single-molecule spectroscopy for biophysical investigation in general

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-IEF-2008
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinateur

University of Zurich
Contribution de l’UE
€ 180 801,44
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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