Obiettivo
Transposable elements are the main component of higher genomes. The LTR retro-transposons replicate via RNA intermediates, and resemble to retroviruses in both structure and life cycle. The active ones encode the Gag protein, which packages the elements int o Virus-Like Particles (VLPs, assembled from multiple Gag units), and the Pol poly-protein, which allows reverse transcription and integration. The LARDs are non-autonomous LTR retro-transposons, and do not encode these proteins. They are able to transpose, probably by parasitizing active partners, as do defective interfering particles on retroviruses in animal cells.
This project aims to study the mechanism of such hyper-parasitic elements, using the LARD within the large Triticeae genome as a model. The fir st objective is to find the autonomous partners, using four integrated approaches. Bioinformatics and PCR analyses will inform about the potential partners for the reverse transcription, and cellular biology and one-hybrid methods about the potential partn ers for the packaging. The second objective is a functional genomics analysis of the dynamic interactions of LARDs with their active partners, by identifying the keys sequences for the packaging and LARD inhibitive activity regarding their active partners.
The final objective is a survey on the abundance and the sequence evolution of the key domains of the LARDs and of their active partners, to shed light the evolution way of the LARD, their generalist vs. specific parasitic activity and the co-evolution of such genomic host-parasite interactions. Fundamental questions on parasitic behaviour in the genome, on host-parasite interactions as on the mechanism of trans-complementation of non-autonomous retro-elements will be addressed. Generic applications include the generation of new molecular markers, new transformation vectors and improvement of transgenic integration, and use of the negative interfering particles as a vaccinating system against retroviruses.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche biologia evoluzionistica
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP6-2002-MOBILITY-5
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
Finlandia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.