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Contenuto archiviato il 2024-05-27

Investigation of the voltage-dependent anion channel 2 (VDAC2) by solid-state NMR and molecular dynamic simulations

Obiettivo

Voltage-dependent anion channels (VDACs) are pore-forming proteins expressed in the outer membrane of eukaryotic mitochondria. The three isoforms of VDAC, i.e. VDAC1, VDAC2 and VDAC3, are known to be expressed ubiquitously in mammalian mitochondria. The individual VDAC isoforms (VDAC1 and VDAC2) are considered to play different roles in the induction of apoptosis through Bcl-2 family proteins and may also play a role in switching apoptotic signaling, whereas the function of VDAC3 is till date not fully known. In particular VDAC2 has been suggested to play a specific role in regulating apoptosis by interacting with, and thereby preventing activation of, the proapoptotic protein BAK. Solid-state NMR (ssNMR) methods will be used to study the structural aspects of VDAC2 and its interactions with apoptotic proteins. These experiments will be performed on isotope-labeled [13C, 15N] protein variants, from which resonance assignments and structural restraints of VDAC2 in lipid bilayers will be obtained. As a complementary method, the molecular simulations (MD) will be performed to study first the homology model on VDAC2 based on the VDAC1 structure, and finally used as the comparison to the ssNMR data. In the MD part the function and interaction mode of the N-terminal helix is of the main interest. In general, the goal of this project is to characterize the structure and dynamics of VDAC2 and to understand its role as an anion channel in the outer mitochondrial membrane in apoptosis and possibly neurodegeneration.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2009-IEF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinatore

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Contributo UE
€ 161 661,00
Indirizzo
HOFGARTENSTRASSE 8
80539 MUNCHEN
Germania

Mostra sulla mappa

Regione
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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