Objectif
Antimicrobial peptides (AMPs) are a promising new class of antibiotics, the mechanism of which usually involves binding to membranes with subsequent disruption. The disruption process is, however, still poorly understood, mostly because it seems to be mediated by states - pore formation or in-depth AMP insertion - that are unordered and very short-lived. My PhD work focused on using and developing biophysical methodologies to study the conditions at which the AMP-mediated disruption is triggered. Models bridging these results with in vivo observations were developed, establishing important relationships between AMP concentration and activity. Molecular Dynamics (MD) simulations allow the visualization of molecular level interactions with spatial and time resolution unsurpassed by experimental techniques, having already provided important clues on AMP-mediated membrane pore formation. In this project the interactions of AMPs with phospholipid bilayers and vesicles will be followed by MD simulations. A comparative study will be performed on a family of peptides derived from two naturally occurring AMPs (cecropin and melittin; base template XKLFKKILKXL-NH2) to gather insight on the different activities and toxicities of each of the peptides, and, from there, better understand the molecular characteristics responsible for those features. Work will also focus on the optimization and application of Coarse Grained (CG) simulation models, which allow significant reductions of processing time without major loss of detail. The interaction models that arise from MD simulations will be experimentally validated, making use of the researcher's background complemented by the host group's strong network of collaborating laboratories. The shift to computer simulation techniques will definitely broaden the researcher’s range of skills, with the added value that these techniques are easily portable and straightforward to implement independently in the future.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique antibiotique
- sciences naturelles mathématiques mathématiques appliquées modèle mathématique
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2009-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
9712CP Groningen
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.