Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS
Zawartość zarchiwizowana w dniu 2024-06-18

Molecular dynamics simulation of the membrane binding and disruption mechanisms of antimicrobial peptides

Cel

Antimicrobial peptides (AMPs) are a promising new class of antibiotics, the mechanism of which usually involves binding to membranes with subsequent disruption. The disruption process is, however, still poorly understood, mostly because it seems to be mediated by states - pore formation or in-depth AMP insertion - that are unordered and very short-lived. My PhD work focused on using and developing biophysical methodologies to study the conditions at which the AMP-mediated disruption is triggered. Models bridging these results with in vivo observations were developed, establishing important relationships between AMP concentration and activity. Molecular Dynamics (MD) simulations allow the visualization of molecular level interactions with spatial and time resolution unsurpassed by experimental techniques, having already provided important clues on AMP-mediated membrane pore formation. In this project the interactions of AMPs with phospholipid bilayers and vesicles will be followed by MD simulations. A comparative study will be performed on a family of peptides derived from two naturally occurring AMPs (cecropin and melittin; base template XKLFKKILKXL-NH2) to gather insight on the different activities and toxicities of each of the peptides, and, from there, better understand the molecular characteristics responsible for those features. Work will also focus on the optimization and application of Coarse Grained (CG) simulation models, which allow significant reductions of processing time without major loss of detail. The interaction models that arise from MD simulations will be experimentally validated, making use of the researcher's background complemented by the host group's strong network of collaborating laboratories. The shift to computer simulation techniques will definitely broaden the researcher’s range of skills, with the added value that these techniques are easily portable and straightforward to implement independently in the future.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

FP7-PEOPLE-2009-IEF
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszenia

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Koordynator

RIJKSUNIVERSITEIT GRONINGEN
Wkład UE
€ 162 248,80
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

Brak danych
Moja broszura 0 0